当前蛋白身份：P04228
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ES0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE MURINE CLASS II ALLELE I-A(G7) COMPLEXED WITH THE GLUTAMIC ACID DECARBOXYLASE (GAD65) PEPTIDE 207-220 提交 2000-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–205（182 aa）
片段：ALPHA CHAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG 4000, 0.2 M LICL (PH 6.6), 1% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.258 |
| 1F3J HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN I-AG7 提交 2000-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
27–208（182 aa）
片段：A-D ALPHA CHAIN
链 D
27–208（182 aa）
片段：A-D ALPHA CHAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.4；pH 4.4
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.299 |
| 1IAO CLASS II MHC I-AD IN COMPLEX WITH OVALBUMIN PEPTIDE 323-339 提交 1998-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
24–209（186 aa）
链 B
28–216（189 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；32% PEG 600, 0.1 IMIDAZOLE MALATE, PH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.320 |
| 1IAO CLASS II MHC I-AD IN COMPLEX WITH OVALBUMIN PEPTIDE 323-339 提交 1998-03-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–209（186 aa）
链 B
28–216（189 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；32% PEG 600, 0.1 IMIDAZOLE MALATE, PH 5.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.320 |
| 2IAD CLASS II MHC I-AD IN COMPLEX WITH AN INFLUENZA HEMAGGLUTININ PEPTIDE 126-138 提交 1998-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
24–209（186 aa）
片段：RESIDUES 126P - 138P OF CHAIN B ARE COVALENTLY LINKED INFLUENZA HEMAGGLUTININ PEPTIDE
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；19% PEG 8000 0.2 M TRIS, PH 7.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.308 |
| 2IAD CLASS II MHC I-AD IN COMPLEX WITH AN INFLUENZA HEMAGGLUTININ PEPTIDE 126-138 提交 1998-03-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–209（186 aa）
片段：RESIDUES 126P - 138P OF CHAIN B ARE COVALENTLY LINKED INFLUENZA HEMAGGLUTININ PEPTIDE
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；19% PEG 8000 0.2 M TRIS, PH 7.4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.308 |
| 3CUP Crystal structure of the MHC class II molecule I-Ag7 in complex with the peptide GAD221-235 提交 2008-04-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–205（182 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；295 K；0.1M Hepes pH 7.5, 28% PEG 8000, 2% Jeffamine 900, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K, pH 7.50
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.286 |
| 3MBE TCR 21.30 in complex with MHC class II I-Ag7HEL(11-27) 提交 2010-03-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
24–205（182 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；20% PEG4000, 0.2M K formate, 0.1M Na Cacodylate., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.281 |
| 3MBE TCR 21.30 in complex with MHC class II I-Ag7HEL(11-27) 提交 2010-03-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
24–205（182 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；20% PEG4000, 0.2M K formate, 0.1M Na Cacodylate., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.281 |
| 5DMK Crystal Structure of IAg7 in complex with RLGL-WE14 提交 2015-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–198（173 aa）
|
未记录 | FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1M Ammonium Citrate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.260 |
| 5DMK Crystal Structure of IAg7 in complex with RLGL-WE14 提交 2015-09-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
26–198（173 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1M Ammonium Citrate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.260 |
| 5DMK Crystal Structure of IAg7 in complex with RLGL-WE14 提交 2015-09-08 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
26–198（173 aa）
|
未记录 | FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1M Ammonium Citrate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.260 |
| 5DMK Crystal Structure of IAg7 in complex with RLGL-WE14 提交 2015-09-08 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
26–198（173 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1M Ammonium Citrate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.260 |
| 6BLQ Crystal Structure of IAg7 in complex with insulin mimotope p8E9E 提交 2017-11-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–208（185 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG3350, 100mM sodium citrate at pH5.0, 5% isopropanol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.203 |
| 6BLR Crystal Structure of IAg7 in complex with insulin mimotope p8E9E6SS 提交 2017-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–208（183 aa）
|
突变：N64C | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；15% PEG4000, 10mM sodium citrate at pH5.0, 100 mM MgCl2
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.228 |
| 6BLX Crystal structure of IAg7 in complex with insulin mimotope p8G9E 提交 2017-11-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–208（183 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；18% PEG20000, 100mM sodium citrate at pH5.0
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.220 |
| 6DFS mouse TCR I.29 in complex with IAg7-p8E9E6ss 提交 2018-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
26–208（183 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；12% PEG 20000, 100mM bicine pH9.0, 20% ethylene glycol
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.285 |
| 6DFW TCR 8F10 in complex with IAg7-p8G9E 提交 2018-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
26–208（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；11% PEG 3350, 100mM formate pH7.0
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.297 |
| 6DFW TCR 8F10 in complex with IAg7-p8G9E 提交 2018-05-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
26–208（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；11% PEG 3350, 100mM formate pH7.0
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.297 |
| 7QHP Structure of I-Ag7 with a bound hybrid insulin peptide 提交 2021-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
24–218（195 aa）
|
突变：I91C | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M ammonium sulfate, 25% w/v PEG 4000, 15% glycerol
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 7RDV TFH TCR bound to MHC Class II IAd presenting aggrecan epitope 提交 2021-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
28–205（178 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；0.1M Sodium Cacodylate pH6.0
15% w/v PEG4000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.265 |
| 7Z50 Structure of the highly diabetogenic 4.1-T cell receptor targeting a hybrid insulin peptide bound to I-Ag7. 提交 2022-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
24–218（195 aa）
|
突变：I91C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MgCl2, 0.1 M Na HEPES pH 7.0, 15% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.261 |
| 7Z50 Structure of the highly diabetogenic 4.1-T cell receptor targeting a hybrid insulin peptide bound to I-Ag7. 提交 2022-03-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
24–218（195 aa）
|
突变：I91C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MgCl2, 0.1 M Na HEPES pH 7.0, 15% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.261 |