当前蛋白身份:P04582
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DDH MHC CLASS I H-2DD HEAVY CHAIN COMPLEXED WITH BETA-2 MICROGLOBULIN AND AN IMMUNODOMINANT PEPTIDE P18-I10 FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS ENVELOPE GLYCOPROTEIN 120 提交 1998-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 P
311–320(10 aa)
片段:RESIDUES 308-322
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.337 |
| 1HHG THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
192–200(9 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1HHG THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
192–200(9 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1QO3 Complex between NK cell receptor Ly49A and its MHC class I ligand H-2Dd 提交 1999-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 P
311–320(10 aa)
片段:RESIDUES 318-327
|
突变:YES | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 1QO3 Complex between NK cell receptor Ly49A and its MHC class I ligand H-2Dd 提交 1999-11-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 P
311–320(10 aa)
片段:RESIDUES 318-327
|
突变:YES | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 1SZT ATOMIC STRUCTURE OF A THERMOSTABLE SUBDOMAIN OF HIV-1 GP41 提交 1997-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
541–574(34 aa)
片段:RESIDUES 546 - 579 AND 628 - 655 CONNECTED BY A SIX-RESIDUE LINKER (SER-GLY-GLY-ARG-GLY-GLY)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.269 |
| 6TVU Structure of native gp41 derived peptide fusion inhibitor 提交 2020-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 待复核 |
链 BBB
616–645(30 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;293.15 K;PEG 4000, 2-Propanol, Citrate
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分辨率 1.25 Å R-free 0.210 |
| 6TVW Structure of native gp41 derived peptide fusion inhibitor 提交 2020-01-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:nonameric(9) 待复核 |
链 DbD
631–644(14 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293.15 K;PEG 3350, ammonium sulfate
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分辨率 1.45 Å R-free 0.298 |
| 9D72 CryoEM structure of anti-MHC-I Fab M1/42 complex with H2-Dd 提交 2024-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 P
311–320(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.67 Å |