当前蛋白身份：P05107
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1L3Y INTEGRIN EGF-LIKE MODULE 3 FROM THE BETA-2 SUBUNIT 提交 2002-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
535–574（40 aa）
片段：RESIDUES 535-574
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）5mM NaPO4；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM I-EGF3 U-15N, 5 mM NaPO4 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM I-EGF3, 5 mM NaPO4 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1YUK The crystal structure of the PSI/Hybrid domain/ I-EGF1 segment from the human integrin beta2 at 1.8 resolution 提交 2005-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
23–125（103 aa）
片段：PSI domain
链 B
365–482（118 aa）
片段：I-EGF domain
|
未记录 | NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；18% PEG 8000, 0.2M calcium acetate, 0.1M Sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.253 |
| 2JF1 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FILAMIN A REPEAT 21 COMPLEXED WITH THE INTEGRIN BETA2 CYTOPLASMIC TAIL PEPTIDE 提交 2007-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 T
735–769（35 aa）
片段：RESIDUES 735-769
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；1.6-1.58 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M NA-ACETATE PH 4.6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.278 |
| 2P26 Structure of the PHE2 and PHE3 fragments of the integrin beta2 subunit 提交 2007-03-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–122（100 aa）
片段：PHE2 and PHE3
链 A
362–535（174 aa）
片段：PHE2 and PHE3
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.2M Magnesium acetate, 0.1M sodium acetate, pH4.6, 18% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.253 |
| 2P28 Structure of the PHE2 and PHE3 fragments of the integrin beta2 subunit 提交 2007-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
23–122（100 aa）
片段：PHE2 fragment
链 B
362–574（213 aa）
片段：PHE3 fragment
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M ammonium sulphate, 15% PEG4000, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.308 |
| 3K6S Structure of integrin alphaXbeta2 ectodomain 提交 2009-10-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.1M imidazole, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 3K6S Structure of integrin alphaXbeta2 ectodomain 提交 2009-10-09 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.1M imidazole, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 3K6S Structure of integrin alphaXbeta2 ectodomain 提交 2009-10-09 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.1M imidazole, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 3K6S Structure of integrin alphaXbeta2 ectodomain 提交 2009-10-09 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.1M imidazole, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 3K6S Structure of integrin alphaXbeta2 ectodomain 提交 2009-10-09 | Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 F
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 H
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 CA CALCIUM ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.1M imidazole, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.335 |
| 3K71 Structure of integrin alphaX beta2 ectodomain 提交 2009-10-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.05M MgCl2, 0.1M imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.373 |
| 3K71 Structure of integrin alphaX beta2 ectodomain 提交 2009-10-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.05M MgCl2, 0.1M imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.373 |
| 3K71 Structure of integrin alphaX beta2 ectodomain 提交 2009-10-11 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.05M MgCl2, 0.1M imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.373 |
| 3K71 Structure of integrin alphaX beta2 ectodomain 提交 2009-10-11 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.05M MgCl2, 0.1M imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.373 |
| 3K71 Structure of integrin alphaX beta2 ectodomain 提交 2009-10-11 | Assembly 5 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 F
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 H
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 CA CALCIUM ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.55M tri-sodium citrate,
0.05M MgCl2, 0.1M imidazole, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.95 Å R-free 0.373 |
| 3K72 Structure of integrin alphaX beta2 提交 2009-10-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；0.915M sodium/potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.335 |
| 3K72 Structure of integrin alphaX beta2 提交 2009-10-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；0.915M sodium/potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.335 |
| 3K72 Structure of integrin alphaX beta2 提交 2009-10-11 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
链 D
23–700（678 aa）
片段：residues 23-700
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 CA CALCIUM ION × 16 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；0.915M sodium/potassium phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.335 |
| 4NEH An internal ligand-bound, metastable state of a leukocyte integrin, aXb2 提交 2013-10-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–696（674 aa）
片段：CD18
|
突变：N190D, N232K, V674C | CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；297 K；6% PEG 8000, 0.2 M Mg acetate, 0.1 M Na cacodylate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.225 |
| 4NEN An internal ligand-bound, metastable state of a leukocyte integrin, aXb2 提交 2013-10-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–696（674 aa）
片段：CD18
|
突变：N190D, N232K and V696C | CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；297 K；6% PEG 8000, 0.2 M Mg acetate, 0.1 M Na cacodylate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.264 |
| 5E6R Structures of leukocyte integrin aLb2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
突变：N232R | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.229 |
| 5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.234 |
| 5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.234 |
| 5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.234 |
| 5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
链 D
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
链 F
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 15 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.234 |
| 5E6U Structures of leukocyte integrin aLb2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
片段：UNP residues 23-482
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Mg-formate dehydrate and 15% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.226 |
| 5E6V Re-refinement of the Crystal Structure of the Plexin-Semaphorin-Integrin Domain/Hybrid Domain/I-EGF1 Segment from the Human Integrin b2 Subunit 提交 2015-10-10 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–125（103 aa）
片段：UNP residues 23-125, 365-482
链 A
365–482（118 aa）
片段：UNP residues 23-125, 365-482
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.229 |
| 5E6W Re-refinement of the Crystal Structure of the Plexin-Semaphorin-Integrin Domain/Hybrid Domain/I-EGF1 Segment from the Human Integrin b2 Subunit 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–122（100 aa）
片段：UNP residues 23-122, 362-574
链 A
362–574（213 aa）
片段：UNP residues 23-122, 362-574
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.270 |
| 5E6X Re-refinement of the Crystal Structure of the Plexin-Semaphorin-Integrin Domain/Hybrid Domain/I-EGF1 Segment from the Human Integrin b2 Subunit 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–122（100 aa）
片段：UNP residues 23-122 and 362 535
链 A
362–535（174 aa）
片段：UNP residues 23-122 and 362 535
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.245 |
| 5ES4 RE-REFINEMENT OF INTEGRIN ALPHAXBETA2 ECTODOMAIN IN THE CLOSED/BENT CONFORMATION 提交 2015-11-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–696（674 aa）
片段：UNP residues 23-696
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.55M TRI-SODIUM CITRATE, 0.1M
IMIDAZOLE, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.307 |
| 5ES4 RE-REFINEMENT OF INTEGRIN ALPHAXBETA2 ECTODOMAIN IN THE CLOSED/BENT CONFORMATION 提交 2015-11-16 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–696（674 aa）
片段：UNP residues 23-696
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.55M TRI-SODIUM CITRATE, 0.1M
IMIDAZOLE, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.307 |
| 5ES4 RE-REFINEMENT OF INTEGRIN ALPHAXBETA2 ECTODOMAIN IN THE CLOSED/BENT CONFORMATION 提交 2015-11-16 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–696（674 aa）
片段：UNP residues 23-696
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.55M TRI-SODIUM CITRATE, 0.1M
IMIDAZOLE, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.307 |
| 5ES4 RE-REFINEMENT OF INTEGRIN ALPHAXBETA2 ECTODOMAIN IN THE CLOSED/BENT CONFORMATION 提交 2015-11-16 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
23–696（674 aa）
片段：UNP residues 23-696
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.55M TRI-SODIUM CITRATE, 0.1M
IMIDAZOLE, PH 6.5, EVAPORATION, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.307 |
| 5XR1 Structure of FLN IG21 domain in complex with C-terminal peptide of beta-2 提交 2017-06-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
752–763（12 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
300 uM [U-13C; U-15N] FLN IG21 domain, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5ZAZ Solution structure of integrin b2 monomer tranmembrane domain in bicelle 提交 2018-02-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
689–739（51 aa）
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突变：C695S | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-13C; U-15N] integrin b2, 20 mM Bis-Tris, 240 mM DHPC, 48 mM POPC, 24 mM POPG, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9ECL Structure of the human integrin beta2 transmembrane domain 提交 2024-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
696–735（40 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；313.2 K；离子强度（mmCIF原始值）0.025；压力 1
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] alphaX peptide, 350 mM 1,2-dihexanoyl-sn-glycero-3-phosphoholine, 105 mM 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine, 25 mM HEPES, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 9RM9 Cryo-EM structure of alphaM/beta2 headpiece complex without alphaM I-domain - the consensus map from alphaM/beta2:C3d-anti-CR3-Nb headpiece complex 提交 2025-06-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
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分辨率 2.60 Å |
| 9T3Y Cryo-EM structure of alphaM/beta2:C3d-anti-CR3-Nb headpiece complex (HPO2 3D class reconstruction) 提交 2025-10-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
|
分辨率 3.44 Å |
| 9T5V Cryo-EM structure of alphaM/beta2:C3d-anti-CR3-Nb headpiece complex (HPO1 3D class reconstruction) 提交 2025-11-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
23–485（463 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
|
分辨率 3.06 Å |
| 9T5W Cryo-EM structure of mutant R61H alphaM/beta2 headpiece complex 提交 2025-11-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–482（460 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
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分辨率 2.74 Å |
| 9T5Z Cryo-EM structure of alphaM/beta2:MEM148-Fab headpiece complex (without alphaM I-domain) 提交 2025-11-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
23–485（463 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |