当前蛋白身份:P05460 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3RX6 Crystal structure of Polarity Suppression protein from Enterobacteria phage P4 提交 2011-05-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–190(190 aa)
未记录 HG MERCURY (II) ION × 2 IOD IODIDE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;7.5% PEG 6000, 5% glycerol, 0.5mM DTT, 300mM NaCl, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.04 Å R-free 0.219
4DVD Crystal structure of the disulphide linked knotted homodimer of Psu 提交 2012-02-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–190(190 aa)
突变:C13S,C117S,T123C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;7.5%(w/v) PEG 6000, 5%(v/v) glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
8PEU Rho-ATPgS-Psu complex III 提交 2023-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 a 1–190(190 aa)
链 b 1–190(190 aa)
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
链 k 1–190(190 aa)
链 l 1–190(190 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.70 Å
8PEW Rho-ATPgS-Psu complex III expanded 提交 2023-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 a 1–190(190 aa)
链 b 1–190(190 aa)
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
链 k 1–190(190 aa)
链 l 1–190(190 aa)
链 m 1–190(190 aa)
链 n 1–190(190 aa)
链 o 1–190(190 aa)
链 p 1–190(190 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 16 MG MAGNESIUM ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 4.30 Å
8PEX Rho P167L-ATPgS-Psu complex II 提交 2023-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 a 1–190(190 aa)
链 b 1–190(190 aa)
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
8PEY Rho P167L-ATPgS-Psu complex II locked 提交 2023-06-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric(23) 与蛋白数一致
链 a 1–190(190 aa)
链 b 1–190(190 aa)
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
9GCS Rho-ATP-Psu complex II 提交 2024-08-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
链 k 1–190(190 aa)
链 l 1–190(190 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9GCT Rho-ATP-Psu complex II expanded 提交 2024-08-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致
链 a 1–190(190 aa)
链 b 1–190(190 aa)
链 c 1–190(190 aa)
链 d 1–190(190 aa)
链 e 1–190(190 aa)
链 f 1–190(190 aa)
链 g 1–190(190 aa)
链 h 1–190(190 aa)
链 i 1–190(190 aa)
链 j 1–190(190 aa)
链 k 1–190(190 aa)
链 l 1–190(190 aa)
链 o 1–190(190 aa)
链 p 1–190(190 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 15 MG MAGNESIUM ION × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å