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Protein Structures and Oligomeric States

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Current Protein Identity：P05460 New Search
8PDB entries
8Biological assembly
74chain/assembly records
Main Difference Dimensions in This Set
Different mutation/modification Different assembly state Different ligand/ion Different experimental method Different experimental conditions Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry Assembly / Oligomeric State Construct Mutations and Modifications Ligands, Ions and Non-polymers Experimental Method Experimental Conditions Structure Quality
3RX6 Crystal structure of Polarity Suppression protein from Enterobacteria phage P4 Deposited 2011-05-10 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 2 PDB declaration: dimeric（2） Consistent with protein count
Chain A 1–190（190 aa）
Not recorded HG MERCURY (II) ION × 2 IOD IODIDE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray crystallization conditions VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；7.5% PEG 6000, 5% glycerol, 0.5mM DTT, 300mM NaCl, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
Resolution 2.04 Å R-free 0.219
4DVD Crystal structure of the disulphide linked knotted homodimer of Psu Deposited 2012-02-23 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 2 PDB declaration: dimeric（2） Consistent with protein count
Chain A 1–190（190 aa）
Mutation：C13S,C117S,T123C No recorded non-water small molecule X-RAY DIFFRACTION
X-ray crystallization conditions VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；7.5%(w/v) PEG 6000, 5%(v/v) glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
Resolution 3.00 Å R-free 0.273
8PEU Rho-ATPgS-Psu complex III Deposited 2023-06-15 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 24 PDB declaration: 24-meric（24） Consistent with protein count
Chain a 1–190（190 aa）
Chain b 1–190（190 aa）
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Chain k 1–190（190 aa）
Chain l 1–190（190 aa）
Not recorded AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen NITROGEN
Resolution 3.70 Å
8PEW Rho-ATPgS-Psu complex III expanded Deposited 2023-06-15 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 34 PDB declaration: 34-meric（34） Consistent with protein count
Chain a 1–190（190 aa）
Chain b 1–190（190 aa）
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Chain k 1–190（190 aa）
Chain l 1–190（190 aa）
Chain m 1–190（190 aa）
Chain n 1–190（190 aa）
Chain o 1–190（190 aa）
Chain p 1–190（190 aa）
Not recorded AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 16 MG MAGNESIUM ION × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen NITROGEN
Resolution 4.30 Å
8PEX Rho P167L-ATPgS-Psu complex II Deposited 2023-06-15 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 22 PDB declaration: 22-meric（22） Consistent with protein count
Chain a 1–190（190 aa）
Chain b 1–190（190 aa）
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Not recorded AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen NITROGEN
Resolution 3.10 Å
8PEY Rho P167L-ATPgS-Psu complex II locked Deposited 2023-06-15 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 23 PDB declaration: 23-meric（23） Consistent with protein count
Chain a 1–190（190 aa）
Chain b 1–190（190 aa）
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Not recorded AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen NITROGEN
Resolution 3.00 Å
9GCS Rho-ATP-Psu complex II Deposited 2024-08-02 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 22 PDB declaration: 22-meric（22） Consistent with protein count
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Chain k 1–190（190 aa）
Chain l 1–190（190 aa）
Not recorded ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.90 Å
9GCT Rho-ATP-Psu complex II expanded Deposited 2024-08-02 Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 30 PDB declaration: 30-meric（30） Consistent with protein count
Chain a 1–190（190 aa）
Chain b 1–190（190 aa）
Chain c 1–190（190 aa）
Chain d 1–190（190 aa）
Chain e 1–190（190 aa）
Chain f 1–190（190 aa）
Chain g 1–190（190 aa）
Chain h 1–190（190 aa）
Chain i 1–190（190 aa）
Chain j 1–190（190 aa）
Chain k 1–190（190 aa）
Chain l 1–190（190 aa）
Chain o 1–190（190 aa）
Chain p 1–190（190 aa）
Not recorded ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 15 MG MAGNESIUM ION × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.70 Å

This page presents structural evidence recorded in PDB/mmCIF.“No recorded non-water small molecule” does not prove that the experimental sample was ligand-free; experimental conditions belong to the PDB experiment, while ligands and copy counts are shown for each biological assembly.