当前蛋白身份：P06876
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GUU CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R1 提交 2002-01-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–89（52 aa）
片段：R1, RESIDUES 38-89
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；1.6-1.7 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML, CRYSTAL WAS TRANSFORMED TO LOW HUMIDITY FORM AND FLASH COOLED, 1-2% V/V OF GLYCEROL WAS ADDED TO PREVENT THE CRYSTAL CRACKING DURING THE FLASH COOLING
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分辨率 1.60 Å R-free 0.223 |
| 1GV2 CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2R3 提交 2002-02-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
89–193（105 aa）
片段：R2R3, RESIDUES 89-193
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；1.6-1.7 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 15 MG/ML, CRYSTAL WAS GROWN BY REPEATED MACROSEEDING, TRANSFORMED TO LOW HUMIDITY FORM AND FLASH COOLED, 1-2% V/V OF GLYCEROL WAS ADDED TO SODIUM CITRATE TO PREVENT THE CRYSTAL CRACKING DURING THE FLASH COOLING
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.210 |
| 1GV5 CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–141（52 aa）
片段：R2, RESIDUES 90-141
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；297 K；1.65 M SODIUM CITRATE PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 10 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K
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分辨率 1.58 Å R-free 0.190 |
| 1GVD CRYSTAL STRUCTURE OF C-MYB R2 V103L MUTANT 提交 2002-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–141（52 aa）
片段：R2, RESIDUES 90-141
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突变：YES | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；297 K；3.15 M AMMONIUM SULFATE IN 0.05 M MES BUFFER AT PH 6.8, PROTEIN CONCENTRATION 10 MG/ML PLUS 10 MM DTT, TEMPERATURE 297 K
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分辨率 1.45 Å R-free 0.195 |
| 1H88 CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX1 提交 2001-01-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 C
35–193（159 aa）
片段：RESIDUES 35-193
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突变：YES | NH4 AMMONIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.05 M AMMONIUM ACETATE, 0.01 M MAGNESIUM CHLORIDE, 10% V/V MPD, 6% V/V GLYCEROL, 0.05 M TRIS HCL BUFFER PH 7.5 AT 24 DEGREES C
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分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 1IDY STRUCTURE OF MYB TRANSFORMING PROTEIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
141–193（53 aa）
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突变：P140M, I155L | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；283 K
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分辨率未提供 |
| 1IDZ STRUCTURE OF MYB TRANSFORMING PROTEIN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
141–193（53 aa）
|
突变：P140M, I155L | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；283 K
|
分辨率未提供 |
| 1MBE MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 1 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–89（52 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
NMR测量条件
pH 6.8；300 K
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分辨率未提供 |
| 1MBF MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 1 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–89（52 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
NMR测量条件
pH 6.8；300 K
|
分辨率未提供 |
| 1MBG MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 2 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–141（52 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
|
分辨率未提供 |
| 1MBH MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 2 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–141（52 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
|
分辨率未提供 |
| 1MBJ MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 3 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
142–193（52 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
NMR测量条件
pH 6.8；300 K
|
分辨率未提供 |
| 1MBK MOUSE C-MYB DNA-BINDING DOMAIN REPEAT 3 提交 1995-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
142–193（52 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；290 K
NMR测量条件
pH 6.8；300 K
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分辨率未提供 |
| 1MSE SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES 提交 1995-01-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
90–193（104 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；310 K
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分辨率未提供 |
| 1MSF SOLUTION STRUCTURE OF A SPECIFIC DNA COMPLEX OF THE MYB DNA-BINDING DOMAIN WITH COOPERATIVE RECOGNITION HELICES 提交 1995-01-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
90–193（104 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1SB0 Solution structure of the KIX domain of CBP bound to the transactivation domain of c-Myb 提交 2004-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
291–315（25 aa）
片段：transcriptional activation domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；27 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM Tris d11 acetate d4; 50 mM NaCl; 2 mM NaN3; pH 5.5 | 90% H20; 10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
291–315（25 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；298 K；压力 1
NMR样品组成
0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
NMR样品组成
13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
NMR样品组成
13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O | 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
链 C
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide
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分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
链 H
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.301 |
| 6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
链 C
284–315（32 aa）
片段：residues 284-315
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, calcium chloride
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分辨率 2.35 Å R-free 0.229 |