当前蛋白身份：P07357
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2QOS Crystal structure of complement protein C8 in complex with a peptide containing the C8 binding site on C8 提交 2007-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
188–198（11 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；26-28% PEG6K, 0.1M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.81 Å R-free 0.244 |
| 2QQH Structure of C8a-MACPF reveals mechanism of membrane attack in complement immune defense 提交 2007-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–366（234 aa）
链 A
410–492（83 aa）
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突变：C164S 突变：C164S | SO4 SULFATE ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；303 K；1M LiSO4, 5mM NiCl2, 100mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 303K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.287 |
| 2RD7 Human Complement Membrane Attack Proteins Share a Common Fold with Bacterial Cytolysins 提交 2007-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
133–492（360 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；6% PEG 20,000, 0.1 M citric acid, 0.025 M Mg(NO3)2, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 3OJY Crystal Structure of Human Complement Component C8 提交 2010-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
31–584（554 aa）
片段：unp residues 31-584
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；281 K；14-16% PEG 4K, 100mM TAPS pH 9.0, 400mM NaCl, 10mM SrCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
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分辨率 2.51 Å R-free 0.337 |
| 6H03 OPEN CONFORMATION OF THE MEMBRANE ATTACK COMPLEX 提交 2018-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 F
31–584（554 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.60 Å |
| 6H04 Closed conformation of the Membrane Attack Complex 提交 2018-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 F
31–584（554 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.60 Å |
| 7NYC cryoEM structure of 3C9-sMAC 提交 2021-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 E
31–584（554 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 7NYD cryoEM structure of 2C9-sMAC 提交 2021-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
31–584（554 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.27 Å |
| 8B0F CryoEM structure of C5b8-CD59 提交 2022-09-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 E
1–584（584 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8B0G 2C9, C5b9-CD59 structure 提交 2022-09-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 E
1–584（584 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8B0H 2C9, C5b9-CD59 cryoEM structure 提交 2022-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 E
1–584（584 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |