当前蛋白身份:P09119 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 9 1–513(513 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 9 1–513(513 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 9 1–513(513 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 9 1–513(513 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:nonameric(9) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 I 1–513(513 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å