当前蛋白身份：P09234
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VRD THE STRUCTURE OF THE ZINC FINGER FROM THE HUMAN SPLICEOSOMAL PROTEIN U1C 提交 2008-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–61（61 aa）
片段：ZINC FINGER DOMAIN, RESIDUES 1-61
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 1.0
NMR样品组成
90%WATER/10%D2O AND 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 3CW1 Crystal Structure of Human Spliceosomal U1 snRNP 提交 2008-04-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–77（77 aa）
片段：residues 1-77
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；38-40% MPD, 0.3M KCl, 0.1M MES.KOH, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 5.49 Å |
| 3CW1 Crystal Structure of Human Spliceosomal U1 snRNP 提交 2008-04-21 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 9
1–77（77 aa）
片段：residues 1-77
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；38-40% MPD, 0.3M KCl, 0.1M MES.KOH, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 5.49 Å |
| 3CW1 Crystal Structure of Human Spliceosomal U1 snRNP 提交 2008-04-21 | Assembly 3 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 0
1–77（77 aa）
片段：residues 1-77
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；38-40% MPD, 0.3M KCl, 0.1M MES.KOH, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 5.49 Å |
| 3CW1 Crystal Structure of Human Spliceosomal U1 snRNP 提交 2008-04-21 | Assembly 4 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–77（77 aa）
片段：residues 1-77
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；38-40% MPD, 0.3M KCl, 0.1M MES.KOH, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 5.49 Å |
| 4PJO Minimal U1 snRNP 提交 2014-05-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–61（61 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MG MAGNESIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Minimal U1 snRNP at 4 mg/ml in 300mM KCl, 20mM KHepes, pH 7.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 0.15 mM polyamine-9 mixed 1:1 with 7% MPD, 180mM KCl, 5mM MgSO4, 50mM NaHepes pH 6.4. Streak seeded.
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分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 4PJO Minimal U1 snRNP 提交 2014-05-12 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 l
1–61（61 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Minimal U1 snRNP at 4 mg/ml in 300mM KCl, 20mM KHepes, pH 7.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 0.15 mM polyamine-9 mixed 1:1 with 7% MPD, 180mM KCl, 5mM MgSO4, 50mM NaHepes pH 6.4. Streak seeded.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 4PJO Minimal U1 snRNP 提交 2014-05-12 | Assembly 3 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–61（61 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 K POTASSIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Minimal U1 snRNP at 4 mg/ml in 300mM KCl, 20mM KHepes, pH 7.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 0.15 mM polyamine-9 mixed 1:1 with 7% MPD, 180mM KCl, 5mM MgSO4, 50mM NaHepes pH 6.4. Streak seeded.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 4PJO Minimal U1 snRNP 提交 2014-05-12 | Assembly 4 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 m
1–61（61 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 EOH ETHANOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；Minimal U1 snRNP at 4 mg/ml in 300mM KCl, 20mM KHepes, pH 7.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 0.15 mM polyamine-9 mixed 1:1 with 7% MPD, 180mM KCl, 5mM MgSO4, 50mM NaHepes pH 6.4. Streak seeded.
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分辨率 3.30 Å R-free 0.255 |
| 6ELD Crystal structure of TIA-1 RRM1 in complex with U1C 提交 2017-09-28 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–61（32 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES, 10% PEG6000 and 10% MPD
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分辨率 2.48 Å R-free 0.242 |
| 6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 1C
1–159（159 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.28 Å |
| 7VPX The cryo-EM structure of the human pre-A complex 提交 2021-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–159（159 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 SJT spliceostatin A (form II) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |