当前蛋白身份：P09527
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1VG0 The crystal structures of the REP-1 protein in complex with monoprenylated Rab7 protein 提交 2004-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–207（207 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；23% PEG 3350, 0.4M diAmmonium Tartrate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 1VG1 GDP-Bound Rab7 提交 2004-04-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–185（185 aa）
片段：Gtpase Domain
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；25% PEG 3350, 0.25M Ammonium Phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 1VG8 GPPNHP-Bound Rab7 提交 2004-04-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–207（207 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；24% PEG 3350, 0.25M Ammonium Phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 1VG8 GPPNHP-Bound Rab7 提交 2004-04-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–207（207 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；24% PEG 3350, 0.25M Ammonium Phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 1VG8 GPPNHP-Bound Rab7 提交 2004-04-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–207（207 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；24% PEG 3350, 0.25M Ammonium Phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 1VG8 GPPNHP-Bound Rab7 提交 2004-04-23 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–207（207 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；24% PEG 3350, 0.25M Ammonium Phosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 1VG9 The crystal structures of the REP-1 protein in complex with C-terminally truncated Rab7 protein 提交 2004-04-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–185（185 aa）
片段：GTPase domain
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；23% PEG 2000 MME, 0.4M Potassium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 1VG9 The crystal structures of the REP-1 protein in complex with C-terminally truncated Rab7 protein 提交 2004-04-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–185（185 aa）
片段：GTPase domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；23% PEG 2000 MME, 0.4M Potassium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 1VG9 The crystal structures of the REP-1 protein in complex with C-terminally truncated Rab7 protein 提交 2004-04-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–185（185 aa）
片段：GTPase domain
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；23% PEG 2000 MME, 0.4M Potassium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |
| 1VG9 The crystal structures of the REP-1 protein in complex with C-terminally truncated Rab7 protein 提交 2004-04-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–185（185 aa）
片段：GTPase domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；23% PEG 2000 MME, 0.4M Potassium Formate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.250 |