当前蛋白身份：P09871
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ELV CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN COMPLEMENT C1S PROTEASE 提交 2000-03-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
358–688（331 aa）
片段：CCP2-SP CATALYTIC FRAGMENT: ASP363-ASP-673 SEGMENT PRECEDED BY AN ASP-LEU SEQUENCE ADDED AT THE N-TERMINAL END
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 2 NES 2-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG 4K 34%, AMMONIUM SULFATE 100mM, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.219 |
| 1NZI Crystal Structure of the CUB1-EGF Interaction Domain of Complement Protease C1s 提交 2003-02-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
16–174（159 aa）
片段：CALCIUM-DEPENDENT INTERACTION DOMAIN
链 B
16–174（159 aa）
片段：CALCIUM-DEPENDENT INTERACTION DOMAIN
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 4000, magnesium chloride, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.234 |
| 4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
292–688（397 aa）
片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)
|
突变：Q436A, I438A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.259 |
| 4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
292–688（397 aa）
片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)
|
突变：Q436A, I438A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.259 |
| 4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
292–688（397 aa）
片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)
链 B
292–688（397 aa）
片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)
|
突变：Q436A, I438A 突变：Q436A, I438A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.259 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
链 D
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
链 C
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.252 |
| 4LOR C1s CUB1-EGF-CUB2 in complex with a collagen-like peptide from C1q 提交 2013-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
17–292（276 aa）
片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 100 mM NaBr, 24% PEG 3350 , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.252 |
| 4LOS C1s CUB2-CCP1 提交 2013-07-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
172–358（187 aa）
片段：CUB2-CCP1 fragment (unp residues 172-358)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris/acetate, 200 mM KH2PO4 + 20% PEG 10K , pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.212 |
| 4LOT C1s CUB2-CCP1-CCP2 提交 2013-07-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
175–423（249 aa）
片段：CUB2-CCP1-CCP2 fragment (unp residues 175-423)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；24% PEG 8K in Bis-tris propane-HCL, containing 200 mM potassium citrate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.292 |
| 5UBM Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor gigastasin 提交 2016-12-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
437–688（252 aa）
链 B
285–436（152 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25 % PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.222 |
| 6F1C C1rC1s complex 提交 2017-11-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
16–292（277 aa）
链 D
16–292（277 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.305 |
| 6F1H C1rC1s complex 提交 2017-11-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
17–292（276 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.340 |
| 6F1H C1rC1s complex 提交 2017-11-22 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
17–292（276 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 LYS LYSINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.340 |
| 8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
358–688（331 aa）
|
未记录 | ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
358–688（331 aa）
|
未记录 | ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
358–688（331 aa）
|
未记录 | ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
358–688（331 aa）
|
未记录 | ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 8TYP Complement Protease C1s Inhibited by 6-(4-phenylpiperazin-1-yl)pyridine-3-carboximidamide 提交 2023-08-25 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
358–688（331 aa）
|
未记录 | SQT 6-(4-phenylpiperazin-1-yl)pyridine-3-carboximidamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate
0.1 M Tris-HCl (pH 8.1)
PEG-4000 24% (w/v)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.196 |
| 8W18 The crystal structure of the Michaelis-Menten complex of a C1s/C1-INH at 3.94 Angstroms 提交 2024-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
292–437（146 aa）
片段：Sushi domains
链 B
438–688（251 aa）
|
突变：S632A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M L-Proline, 0.1M HEPES (pH 6.5), and 12% PEG 3,350
|
分辨率 3.94 Å R-free 0.281 |
| 9X1H Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121 提交 2025-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
16–292（277 aa）
链 B
16–292（277 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES(7.5), 150mM NaCl, 3mM CaCl2, 0.03% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |