当前蛋白身份：P0A7T1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4V5B Structure of PDF binding helix in complex with the ribosome. 提交 2007-11-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 BM
2–118（117 aa）
片段：RESIDUES 2-118
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 170 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 3.74 Å R-free 0.323 |
| 4V5B Structure of PDF binding helix in complex with the ribosome. 提交 2007-11-22 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 未唯一映射
参考区间未声明
片段：RESIDUES 2-118
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 173 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 3.74 Å R-free 0.323 |
| 5UZ4 The cryo-EM structure of YjeQ bound to the 30S subunit suggests a fidelity checkpoint function for this protein in ribosome assembly 提交 2017-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–118（118 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GGM 3'-O-(N-methylanthraniloyl)-beta:gamma-imidoguanosine-5'-triphosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.80 Å |
| 5WF0 70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C2) 提交 2017-07-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 m
2–116（115 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1480 K POTASSIUM ION × 5 PHE PHENYLALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；5 second blot time,
no wait time
|
分辨率 3.60 Å |
| 5WFS 70S ribosome-EF-Tu H84A complex with GTP and near-cognate tRNA (Complex C4) 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 m
2–116（115 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1471 K POTASSIUM ION × 7 PHE PHENYLALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；5 second blot time,
no wait time
|
分辨率 3.00 Å |
| 6AWB Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in non-rotated state 提交 2017-09-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；20 mM Tris-HCl, pH 7.0, 100 mM NH4Cl, 10 mM MgCl2, 0.5 mM EDTA, 6 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 uL of 50 nM 30S and 150 nM RNAP was applied to the grid. After a 30 second incubation, the grid was blotted for 5 seconds at blotting power 8.
|
分辨率 6.70 Å |
| 6AWC Structure of 30S ribosomal subunit and RNA polymerase complex in rotated state 提交 2017-09-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；20 mM Tris-HCl, pH 7.0, 100 mM NH4Cl, 10 mM MgCl2, 0.5 mM EDTA, 6 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 uL of 50 nM 30S and 150 nM RNAP was applied to the grid. After a 30 second incubation, the grid was blotted for 5 seconds at blotting power 8.
|
分辨率 7.90 Å |
| 6AWD Structure of 30S (S1 depleted) ribosomal subunit and RNA polymerase complex 提交 2017-09-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；20 mM Tris-HCl, pH 7.0, 100 mM NH4Cl, 10 mM MgCl2, 0.5 mM EDTA, 6 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 uL of 50 nM 30S and 150 nM RNAP was applied to the grid. After a 30 second incubation, the grid was blotted for 5 seconds at blotting power 8.
|
分辨率 8.10 Å |
| 9OZ9 Flavobacterium johnsoniae 70S initiation complex with Shine-Dalgarno-less mRNA. 提交 2025-06-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 r
1–114（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.60 Å |
| 9OZN Flavobacterium johnsoniae 70S initiation complex with rpsU mRNA containing Shine-Dalgarno sequence. State 1. 提交 2025-06-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 r
1–114（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9OZZ Flavobacterium johnsoniae 70S initiation complex with rpsU mRNA containing Shine-Dalgarno sequence. State 2. 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 r
1–114（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.50 Å |
| 9P0E Flavobacterium johnsoniae ZAM64 mutant 70S initiation complex with rpsU mRNA containing Shine-Dalgarno sequence. 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 r
1–114（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9ZCD Flavobacterium johnsoniae 30S ribosomal subunit. 提交 2025-11-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 r
1–114（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |