当前蛋白身份：P11987
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FYZ METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II REDUCED BY SOAKING 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.230 |
| 1FZ0 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GROWN ANAEROBICALLY 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.230 |
| 1FZ1 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III OXIDIZED 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.234 |
| 1FZ2 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II MIXED-VALENT GENERATED BY CRYSTAL SOAKING 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.229 |
| 1FZ3 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAK AT PH 6.2 (0.1 M PIPES) 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.228 |
| 1FZ4 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED AT PH 8.5 (0.1 M TRIS) 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.256 |
| 1FZ5 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II CRYSTALLIZED ANAEROBICALLY FROM REDUCED ENZYME 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.253 |
| 1FZ6 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II SOAKED IN 1 M METHANOL 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 MOH METHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION,
HANGING DROP at 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.244 |
| 1FZ7 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM III SOAKED IN 0.9 M ETHANOL 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 FMT FORMIC ACID × 1 EOH ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid. pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.255 |
| 1FZ8 METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II COCRYSTALLIZED WITH DIBROMOMETHANE 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 2BM DIBROMOMETHANE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, dibromomethane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.250 |
| 1FZ9 Methane monooxygenase hydroxylase, form II cocrystallized with iodoethane 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 3 ETI IODOETHANE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, 1,10-decanedioic acid, iodoethane. pH 7.0,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 1FZH METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM II PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 XE XENON × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 8000, CaCl2, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 1FZI METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE, FORM I PRESSURIZED WITH XENON GAS 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–170（170 aa）
链 F
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 XE XENON × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 4000, ammonium acetate, Li2SO4, MOPS, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.253 |
| 1MMO CRYSTAL STRUCTURE OF A BACTERIAL NON-HAEM IRON HYDROXYLASE THAT CATALYSES THE BIOLOGICAL OXIDATION OF METHANE 提交 1994-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
3–164（162 aa）
链 H
3–164（162 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1MTY METHANE MONOOXYGENASE HYDROXYLASE FROM METHYLOCOCCUS CAPSULATUS (BATH) 提交 1996-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
3–164（162 aa）
链 H
3–164（162 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；25 MM LI2SO4, 50 MM NH4OAC, 5% PEG 4000, IN 25 MM MOPS PH 7.0 WITH A RESERVOIR OF 20% PEG 4000
|
分辨率 1.70 Å |
| 1XMF Structure of Mn(II)-Soaked Apo Methane Monooxygenase Hydroxylase Crystals from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
链 F
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, CaCl2, PEG8000, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.263 |
| 1XMG Crystal structure of apo methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
链 F
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, glycerol, azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.261 |
| 1XMH Structure of Co(II) reconstituted methane monooxygenase hydroxylase from M. capsulatus (Bath) 提交 2004-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
链 F
1–169（169 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；MOPS, PEG 8000, calcium chloride, sodium azide, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.225 |
| 1XU3 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-soaked with bromophenol 提交 2004-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 BML 4-BROMOPHENOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K, pH 7.00
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.245 |
| 1XU5 Soluble methane monooxygenase hydroxylase-phenol soaked 提交 2004-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 OH HYDROXIDE ION × 2 IPH PHENOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.228 |
| 1XVB soluble methane monooxygenase hydroxylase: 6-bromohexanol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
链 F
0–169（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 BHL 6-BROMOHEXAN-1-OL × 10 BBU 1-BROMOBUTANE × 1 BBX 1-BROMOETHANE × 1 CA CALCIUM ION × 1 3BR 1-BROMOPROPANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.251 |
| 1XVC soluble methane monooxygenase hydroxylase: 8-bromooctanol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 BR BROMIDE ION × 2 5BR 1-BROMOPENTANE × 1 BMM BROMOMETHANE × 1 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 1XVD Soluble methane monooxygenase hydroxylase: 4-fluorophenol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 FPN 4-FLUOROPHENOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；273 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 1XVE soluble methane monooxygenase hydroxylase: 3-bromo-3-butenol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 3BB 3-BROMOBUT-3-EN-1-OL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 1XVF soluble methane monooxygenase hydroxylase: chloropropanol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 3CL 3-CHLOROPROPANOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, NaN3, CaCl2, glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 1XVG soluble methane monooxygenase hydroxylase: bromoethanol soaked structure 提交 2004-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
链 F
0–169（170 aa）
片段：gamma subunit
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 BRJ 2-BROMOETHANOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；MOPS, PEG 8000, CaCl2, NaN3, glyerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.230 |
| 4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–170（170 aa）
链 H
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.258 |
| 4GAM Complex structure of Methane monooxygenase hydroxylase and regulatory subunit 提交 2012-07-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–170（170 aa）
链 R
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES and 15% PEG 20,000 (w/v) ure 298K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.258 |
| 7TC7 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by quantifoil) 提交 2021-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
1–170（170 aa）
链 H
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7TC8 Cryo-EM structure of methane monooxygenase hydroxylase (by graphene) 提交 2021-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
1–170（170 aa）
链 H
1–170（170 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；30 mM HEPES, pH 7, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |