当前蛋白身份：P14210
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BHT NK1 FRAGMENT OF HUMAN HEPATOCYTE GROWTH FACTOR 提交 1998-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
35–210（176 aa）
片段：NK1 FRAGMENT, HEPARIN BINDING DOMAIN PLUS C-MET BINDING DOMAIN
链 B
35–210（176 aa）
片段：NK1 FRAGMENT, HEPARIN BINDING DOMAIN PLUS C-MET BINDING DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；40% PEG 3400, 0.1M HEPES PH 7.5, 0.3M AMMONIUM SULFATE. PROTEIN CONCENTRATION OF 3MG/ML
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 1GMN CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-19 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 B
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：YES 突变：YES | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.55M SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE 0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 1GMO CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-20 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 B
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1GMO CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-20 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 D
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1GMO CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-20 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 F
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1GMO CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-20 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 H
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1GP9 A New Crystal Form of the Nk1 Splice Variant of Hgf/Sf Demonstrates Extensive Hinge Movement and Suggests that the Nk1 Dimer Originates by Domain Swapping 提交 2001-10-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
40–210（171 aa）
片段：NK1, RESIDUES 40-210
链 B
40–210（171 aa）
片段：NK1, RESIDUES 40-210
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；18% PEG4000, 10% 2-PROPANOL, 0.1M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 1GP9 A New Crystal Form of the Nk1 Splice Variant of Hgf/Sf Demonstrates Extensive Hinge Movement and Suggests that the Nk1 Dimer Originates by Domain Swapping 提交 2001-10-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
40–210（171 aa）
片段：NK1, RESIDUES 40-210
链 D
40–210（171 aa）
片段：NK1, RESIDUES 40-210
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；18% PEG4000, 10% 2-PROPANOL, 0.1M SODIUM HEPES, PH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 1NK1 NK1 FRAGMENT OF HUMAN HEPATOCYTE GROWTH FACTOR/SCATTER FACTOR (HGF/SF) AT 2.5 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1998-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：NK1
链 B
28–210（183 aa）
片段：NK1
|
突变：A29V 突变：A29V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.7；18% PEG4000, 0.20M SODIUM ACETATE, 0.15M TRIS, PH 8.5 , pH 8.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.319 |
| 1SHY The Crystal Structure of HGF beta-chain in Complex with the Sema Domain of the Met Receptor. 提交 2004-02-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
495–728（234 aa）
片段：HGF beta chain
|
突变：C604S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；PEG, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 3.22 Å R-free 0.270 |
| 1SI5 Protease-like domain from 2-chain hepatocyte growth factor 提交 2004-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
495–728（234 aa）
片段：protease-like domain
|
突变：Cys604Ser | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；NaCl, CaCl2, PEG 1500, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.301 |
| 2HGF HAIRPIN LOOP CONTAINING DOMAIN OF HEPATOCYTE GROWTH FACTOR, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
31–127（97 aa）
片段：AMINO TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K
|
分辨率未提供 |
| 2QJ2 A Mechanistic Basis for Converting a Receptor Tyrosine Kinase Agonist to an Antagonist 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–209（182 aa）
片段：residues 28-209
链 B
28–209（182 aa）
片段：residues 28-209
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM ammonium sulfate, 26-29% PEG 4000 (w/w), 100 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.5 mM beta-octyl glucoside, and 5% ethylene glycol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.248 |
| 3HMS Crystal Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, orthorhombic crystal form 提交 2009-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–126（99 aa）
片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM Ammonium sulfate, 28-32% PEG 1000 or 2000, 50 mM Tris-HCl pH 8.0, 5% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.255 |
| 3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–126（99 aa）
片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
链 B
28–126（99 aa）
片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–126（99 aa）
片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–126（99 aa）
片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 3HN4 Crystal structure of the NK2 fragment (28-289) of human hepatocyte growth factor/scatter factor 提交 2009-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–289（262 aa）
片段：UNP residues 28-289
|
突变：K132E, R134E, C214A | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM Ammonium sulfate, 17-23% PEG 2000 or 4000, 100 mM HEPES pH 8.0, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.5 mM Beta-octyl glucoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.333 |
| 3MKP Crystal structure of 1K1 mutant of Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor fragment NK1 in complex with heparin 提交 2010-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：K132E, R134E 突变：K132E, R134E | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SGN 2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.243M Ammonium Sulfate, 22.295% PEG 3350, 0.1M Na-Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.261 |
| 3MKP Crystal structure of 1K1 mutant of Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor fragment NK1 in complex with heparin 提交 2010-04-15 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 D
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：K132E, R134E 突变：K132E, R134E | SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.243M Ammonium Sulfate, 22.295% PEG 3350, 0.1M Na-Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.261 |
| 3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–288（261 aa）
片段：NK2
链 B
28–288（261 aa）
片段：NK2
|
突变：G146D, C214S 突变：G146D, C214S | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.217 |
| 3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–288（261 aa）
片段：NK2
|
突变：G146D, C214S | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.217 |
| 3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–288（261 aa）
片段：NK2
|
突变：G146D, C214S | MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.217 |
| 4D3C Crystal structure of the NK1 domain of HGF in complex with anti-HGF monoclonal antibody SFN68. 提交 2014-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
32–210（179 aa）
片段：RESIDUES 23-210
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.62 Å R-free 0.298 |
| 4K3J Crystal structure of Onartuzumab Fab in complex with MET and HGF-beta 提交 2013-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
495–721（227 aa）
片段：unp residues 495-721
|
突变：C604S | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；298 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.2, 20% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 4O3T Zymogen HGF-beta/MET with Zymogen Activator Peptide ZAP.14 提交 2013-12-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
495–728（234 aa）
片段：HGF-beta (UNP Residues 25-567)
|
突变：V495G/C604S | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG6000, 800 mM NaCl, 400 mM trimethylammonium oxide, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.276 |
| 4O3U Zymogen HGF-beta/MET with Zymogen Activator Peptide ZAP2.3 提交 2013-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
495–728（234 aa）
片段：HGF-beta (UNP Residues 25-567)
|
突变：V495G/C604S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；8% PEG8000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.251 |
| 5COE The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with HEPES 提交 2015-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.264 |
| 5CP9 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MB605 提交 2015-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | 6O5 3-(furan-2-yl)propanoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 5CS1 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 nM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 5CS3 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with (H)EPPS 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | EP1 3-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]PROPANE-1-SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.318 |
| 5CS5 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with PIPES 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | PIN PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 5CS9 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MES 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000. 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 5CSQ The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MOPS 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM NA Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.274 |
| 5CT1 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with CHES 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.269 |
| 5CT2 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with CAPS 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.295 |
| 5CT3 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with 2FA 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
链 B
28–210（183 aa）
片段：UNP residues 28-210
|
突变：A29V 突变：A29V | 54O 3-hydroxypropane-1-sulfonic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 6LZ9 t8E4 antibody Fab complexed with the active form of HGF 提交 2020-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
388–494（107 aa）
片段：K4 domain
链 B
495–728（234 aa）
片段：SP domain
|
突变：N402Q, T476G, K491I, Q492E, L493G 突变：C561S, N566Q, N653Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；10 % (w/v) PEG 10000, 0.1M Magnesium acetate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.297 |
| 7MO7 Cryo-EM structure of 2:2 c-MET/HGF holo-complex 提交 2021-05-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–728（728 aa）
链 D
1–728（728 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7MO8 Cryo-EM structure of 1:1 c-MET I/HGF I complex after focused 3D refinement of holo-complex 提交 2021-05-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–728（728 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7MO9 Cryo-EM map of the c-MET II/HGF I/HGF II (K4 and SPH) sub-complex 提交 2021-05-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–728（728 aa）
链 D
1–728（728 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7MOA Cryo-EM structure of the c-MET II/HGF I complex bound with HGF II in a rigid conformation 提交 2021-05-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–728（728 aa）
链 D
1–728（728 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 7MOB Cryo-EM structure of 2:2 c-MET/NK1 complex 提交 2021-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–210（210 aa）
链 B
1–210（210 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 7OCL K1K1, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
125–211（87 aa）
链 A
129–210（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM Sodium nitrate, 30 mM Sodium phosphate dibasic, 30 mM Ammonium sulfate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |
| 7OCL K1K1, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
125–211（87 aa）
链 B
129–210（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM Sodium nitrate, 30 mM Sodium phosphate dibasic, 30 mM Ammonium sulfate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |
| 7OCM K1K1H6, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
125–211（87 aa）
链 A
129–210（82 aa）
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290.15 K；100 mM MOPS/HEPES pH 7.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 20% v/v glycerol, 10% w/v PEG4000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |