当前蛋白身份：P17574
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：180-MERIC（180） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 60 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 1A34 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX 提交 1998-01-28 | Assembly 6 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：45-meric（45） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 15 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
liquid diffusion in microgravity；pH 6.5；PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.184 |
| 4NIA Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined at room temperature to 1.8 A Resolution using NCS Restraints 提交 2013-11-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：240-meric（240） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 PO4 PHOSPHATE ION × 12 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION；pH 6.5；296 K；9 crystals were grown in microgravity aboard IML-I mission of the U.S. Space Shuttle over 12 days using 20% ammonium sulfate as precipitant, pH 6.50, LIQUID DIFFUSION, temperature 296K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；12 crystals grown from 8% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 14-16% ammonium sulfate, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.156 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：240-meric（240） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 60 SO4 SULFATE ION × 120 MG MAGNESIUM ION × 60 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 SO4 SULFATE ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 5 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ8 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using icosahedral constraints 提交 2014-02-07 | Assembly 6 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 15 SO4 SULFATE ION × 30 MG MAGNESIUM ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.279 |
| 4OQ9 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using non-crystallographic symmetry restraints 提交 2014-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：240-meric（240） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 SO4 SULFATE ION × 72 NA SODIUM ION × 68 MG MAGNESIUM ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.250 |
| 4OQ9 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using non-crystallographic symmetry restraints 提交 2014-02-07 | Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 18 NA SODIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.250 |
| 4OQ9 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using non-crystallographic symmetry restraints 提交 2014-02-07 | Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 18 NA SODIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.250 |
| 4OQ9 Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined to 1.4 A Resolution using non-crystallographic symmetry restraints 提交 2014-02-07 | Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 18 NA SODIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；crystals grown from 15% ammonium sulfate on earth with a reservoir of 15% ammonium sulfate over 14 days., pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.250 |
| 5BKL Crystallographic structure of the cubic crystal form of STMV (77.9 degree rotation) grown from NaCl 提交 2021-03-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：117-meric（117） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 120 MG MAGNESIUM ION × 39 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. The drops were composed of equal amounts of a 5 mg/ml stock virus solution buffered at pH6.5 with 0.1 M phosphate, and the reservoir solution which was 8% w/v NaCl buffered with 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was carried out at 4 degrees C.
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.256 |
| 5BKN Crystallographic structure of a cubic crystal form of STMV (84.5 degree rotation) grown from chloride 提交 2021-03-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：117-meric（117） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 78 MG MAGNESIUM ION × 42 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using .6 ml reservoirs. The drops were composed of equal volumes of a 5 mg/ml virus stock solution of 0.1 M phosphate at pH 6.5, and the reservoir solution, which was 8% NaCl w/v in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was at 4 degrees C.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 5BKQ Crystallographic structure of a cubic form of STMV grown from nitrate 提交 2021-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 306 MG MAGNESIUM ION × 27 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. Drops were equal amounts of a 5 mg/ml virus stock solution buffered with 0.1 M phosphate at pH 6.5, and the reservoir solution which was 20% w/v sodium nitrate in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was carried out at 4 degrees C.
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.273 |
| 7M2T Crystallographic Structure of the Monoclinic Form of Satellite Tobacco Mosaic Virus 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：218-meric（218） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 BB
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 CC
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 DD
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 EE
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 FF
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 LL
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 MM
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 NN
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
链 OO
1–159（159 aa）
链 PP
1–159（159 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 PO4 PHOSPHATE ION × 12 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；279 K；Crystals grown by vapor diffusion as sitting drops. Drops were equal volumes of a 6 mg/ml STMV stock solution buffered at pH 6.5 with 0.1 M phosphate. The reservoirs were 16% saturated ammonium sulfate in 0.1 M phosphate at pH 6.5. Drops were 6 to 8 ul with 0.60 ml reservoirs. Crystals were grown at 4 degrees C over a weeks time.
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分辨率 2.71 Å R-free 0.177 |
| 7M2V Crystallographic Structure of the Rhombohedral Crystal Form of STMV Grown from Chloride 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：120-meric（120） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 FX
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 NN
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 39 MG MAGNESIUM ION × 24 PO4 PHOSPHATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with 0.6 ml reservoirs and 6 to 8 ul drops. Drops were equal amounts of a 5 mg/ml virus stock solution buffered at pH 6.5 with 0.1 M phosphate, and the reservoir solution. The reservoir solution was 4% w/v NaCl in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was at 4 degrees C.
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分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 7M3R Crystallographic Structure of the Rhombohedral Crystal Form of STMV Grown from Bromide 提交 2021-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
|
未记录 | BR BROMIDE ION × 573 MG MAGNESIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates with 0.6 ml reservoirs and 6 to 8 ul drops. The drops were equal amounts of a 5 mg/ml virus stock solution buffered at pH 6.5 with 0.1 M phosphate. The reservoirs were 5% w/v NaBr in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was at 4 degrees C and the time of development was about 10 days.
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分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 7M3T Crystallographic structure of a cubic crystal of STMV (80.7 degree rotation about 111) grown from chloride 提交 2021-03-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：117-meric（117） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 21 CL CHLORIDE ION × 42 MG MAGNESIUM ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. The drops were equal volumes of 5 mg/ml STMV in 0.1 M phosphate at pH 6.5 and the reservoir solution, which was 8% w/v NaCl in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was carried out at 4 degrees C.
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分辨率 3.20 Å R-free 0.254 |
| 7M50 Crystallographic structure of a cubic crystal form of STMV grown from ammonium sulfate 提交 2021-03-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：117-meric（117） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 15 CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. Drops were 6 to 8 ul and were composed of equal volumes of a 5 mg/ml virus stock solution containing 0.1 M phosphate at pH 6.5, and the reservoir solution. The reservoir solution was 18% ammonium sulfate in 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was carried out at 4 degrees C.
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分辨率 2.31 Å R-free 0.271 |
| 7M54 Crystallographic structure of a cubic crystal form of STMV grown from bromide 提交 2021-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 18 BR BROMIDE ION × 546 MG MAGNESIUM ION × 27 CL CHLORIDE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；279 K；crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. Drops were 6 to 8 ul and composed of equal volumes of a 5 mg/ml virus stock solution buffered at pH 6.5 with 0.1M phosphate, and the reservoir solution. The reservoir solution was 18% w/v NaBr buffered with 0.1 M phosphate at pH 6.0. Crystallization was carried out at 4 degrees C.
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分辨率 3.80 Å R-free 0.285 |
| 7M57 Crystallographic structure of a primitive orthorhombic crystal form of STMV 提交 2021-03-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：218-meric（218） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–159（159 aa）
链 B
1–159（159 aa）
链 BB
1–159（159 aa）
链 C
1–159（159 aa）
链 CC
1–159（159 aa）
链 D
1–159（159 aa）
链 DD
1–159（159 aa）
链 E
1–159（159 aa）
链 EE
1–159（159 aa）
链 F
1–159（159 aa）
链 FF
1–159（159 aa）
链 G
1–159（159 aa）
链 GG
1–159（159 aa）
链 H
1–159（159 aa）
链 HH
1–159（159 aa）
链 I
1–159（159 aa）
链 II
1–159（159 aa）
链 J
1–159（159 aa）
链 JJ
1–159（159 aa）
链 K
1–159（159 aa）
链 KK
1–159（159 aa）
链 L
1–159（159 aa）
链 LL
1–159（159 aa）
链 M
1–159（159 aa）
链 MM
1–159（159 aa）
链 N
1–159（159 aa）
链 NN
1–159（159 aa）
链 O
1–159（159 aa）
链 OO
1–159（159 aa）
链 PP
1–159（159 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；Crystals were grown by sitting drop vapor diffusion in Cryschem plates using 0.6 ml reservoirs. The drops were 6 to 8 ul and composed of equal volumes of a 5 mg/ml virus stock solution buffered with 0.1 M phosphate at pH 6.5, and the reservoir. The reservoirs were 16% ammonium sulfate buffered at pH 6.0 with 0.1 M phosphate. Crystallization was a room temperature.
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分辨率 4.00 Å |