当前蛋白身份:P17888
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
链 B
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.292 |
| 2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
链 D
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.292 |
| 2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
链 B
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.292 |
| 2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
链 D
1–105(105 aa)
片段:DNA binding domein
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.292 |
| 2D7G Crystal structure of the aa complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;12% PEG 6000, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.309 |
| 2D7G Crystal structure of the aa complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;12% PEG 6000, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.309 |
| 2D7H Crystal structure of the ccc complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
链 C
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.293 |
| 2DWL Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.302 |
| 2DWL Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.302 |
| 2DWM Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.318 |
| 2DWM Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.318 |
| 2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.333 |
| 2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.333 |
| 2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 B
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.333 |
| 2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 | Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
链 D
1–105(105 aa)
片段:Residues 1-105
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.333 |
| 6DCR E. coli PriA helicase winged helix domain deletion protein 提交 2018-05-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–732(732 aa)
|
突变:delta 114-174 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;50 mM HEPES-HCl pH 7.5, 9.5 % PEG 4000, 4 % Isopropanol, 8 % glycerol, 50 mM sodium malonate, and 25-100 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 6DCR E. coli PriA helicase winged helix domain deletion protein 提交 2018-05-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–732(732 aa)
|
突变:delta 114-174 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;50 mM HEPES-HCl pH 7.5, 9.5 % PEG 4000, 4 % Isopropanol, 8 % glycerol, 50 mM sodium malonate, and 25-100 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.215 |
| 8FAK DNA replication fork binding triggers structural changes in the PriA DNA helicase that regulate the PriA-PriB replication restart pathway in E. coli 提交 2022-11-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 H
1–732(732 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9ZBT Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致 |
链 H
1–732(732 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9ZBU Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 H
2–732(731 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |