当前蛋白身份:P17888 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
链 B 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
链 D 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
链 B 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2D7E Crystal structure of N-terminal domain of PriA from E.coli 提交 2005-11-18 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
链 D 1–105(105 aa) 片段:DNA binding domein
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M sodium citrate, 0.3M ammonium sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.292
2D7G Crystal structure of the aa complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;12% PEG 6000, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.309
2D7G Crystal structure of the aa complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.2;293 K;12% PEG 6000, 0.1M sodium acetate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.309
2D7H Crystal structure of the ccc complex of the N-terminal domain of PriA 提交 2005-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
链 C 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.293
2DWL Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.302
2DWL Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.302
2DWM Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.318
2DWM Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.8;293 K;0.1M sodium citrate, 0.2M ammonium sulfate, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.318
2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.333
2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.333
2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 A 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 B 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.333
2DWN Crystal structure of the PriA protein complexed with oligonucleotides 提交 2006-08-15 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 C 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
链 D 1–105(105 aa) 片段:Residues 1-105
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;293 K;0.1M sodium citrate, 0.4M ammonium sulfate, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.333
6DCR E. coli PriA helicase winged helix domain deletion protein 提交 2018-05-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–732(732 aa)
突变:delta 114-174 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;50 mM HEPES-HCl pH 7.5, 9.5 % PEG 4000, 4 % Isopropanol, 8 % glycerol, 50 mM sodium malonate, and 25-100 mM sodium fluoride
分辨率 1.98 Å R-free 0.215
6DCR E. coli PriA helicase winged helix domain deletion protein 提交 2018-05-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–732(732 aa)
突变:delta 114-174 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;297 K;50 mM HEPES-HCl pH 7.5, 9.5 % PEG 4000, 4 % Isopropanol, 8 % glycerol, 50 mM sodium malonate, and 25-100 mM sodium fluoride
分辨率 1.98 Å R-free 0.215
8FAK DNA replication fork binding triggers structural changes in the PriA DNA helicase that regulate the PriA-PriB replication restart pathway in E. coli 提交 2022-11-28 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 H 1–732(732 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9ZBT Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 H 1–732(732 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9ZBU Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 H 2–732(731 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å