当前蛋白身份:P23284
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CYN CYCLOPHILIN B COMPLEXED WITH [D-(CHOLINYLESTER)SER8]-CYCLOSPORIN 提交 1995-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
31–208(178 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.85 Å |
| 3ICH Crystal structure of cyclophilin B at 1.2 A resolution 提交 2009-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
34–216(183 aa)
片段:UNP residues 34-216
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;25% w/v PEG 1500, 0.1M MMT buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.162 |
| 3ICI Crystal structure of cyclophilin B in complex with calmegin fragment 提交 2009-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
34–216(183 aa)
片段:UNP residues 34-216
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;22% w/v PEG 8000, 10mM ZnCl2, 0.1M Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 3ICI Crystal structure of cyclophilin B in complex with calmegin fragment 提交 2009-07-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
34–216(183 aa)
片段:UNP residues 34-216
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;22% w/v PEG 8000, 10mM ZnCl2, 0.1M Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 8K0F Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, in its apo state 提交 2023-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
1–216(216 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 8K0I Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, in its dual-ternary state 提交 2023-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
1–216(216 aa)
链 c
1–216(216 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8K0M Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to 2-oxoglutarate 提交 2023-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
1–216(216 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8K17 Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to collagen alpha-1(I) chain 提交 2023-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–216(216 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.18 Å |
| 8KC9 Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to cyclosporin A 提交 2023-08-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–216(216 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.75 Å |