当前蛋白身份:P23284 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CYN CYCLOPHILIN B COMPLEXED WITH [D-(CHOLINYLESTER)SER8]-CYCLOSPORIN 提交 1995-05-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 31–208(178 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.85 Å
3ICH Crystal structure of cyclophilin B at 1.2 A resolution 提交 2009-07-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 34–216(183 aa) 片段:UNP residues 34-216
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;25% w/v PEG 1500, 0.1M MMT buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.20 Å R-free 0.162
3ICI Crystal structure of cyclophilin B in complex with calmegin fragment 提交 2009-07-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 34–216(183 aa) 片段:UNP residues 34-216
未记录 ZN ZINC ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;22% w/v PEG 8000, 10mM ZnCl2, 0.1M Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.239
3ICI Crystal structure of cyclophilin B in complex with calmegin fragment 提交 2009-07-17 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 34–216(183 aa) 片段:UNP residues 34-216
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;22% w/v PEG 8000, 10mM ZnCl2, 0.1M Tris buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.239
8K0F Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, in its apo state 提交 2023-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8K0I Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, in its dual-ternary state 提交 2023-07-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
链 c 1–216(216 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8K0M Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to 2-oxoglutarate 提交 2023-07-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8K17 Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to collagen alpha-1(I) chain 提交 2023-07-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8KC9 Human collagen prolyl processing enzyme complex, P3H1/CRTAP/PPIB heterotrimer, bound to cyclosporin A 提交 2023-08-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–216(216 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FE FE (III) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å