当前蛋白身份:P23367 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1B62 MUTL COMPLEXED WITH ADP 提交 1999-01-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–349(349 aa) 片段:ATPASE FRAGMENT
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;pH 8.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
1B63 MUTL COMPLEXED WITH ADPNP 提交 1999-01-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–331(331 aa) 片段:ATPASE FRAGMENT
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;pH 8.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.261
1BKN CRYSTAL STRUCTURE OF AN N-TERMINAL 40KD FRAGMENT OF E. COLI DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTL 提交 1998-07-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL 40KD FRAGMENT
链 B 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL 40KD FRAGMENT
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.6;pH 6.6
分辨率 2.90 Å R-free 0.300
1X9Z Crystal structure of the MutL C-terminal domain 提交 2004-08-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
链 B 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;277 K;NaCl, Li2SO4, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.278
1X9Z Crystal structure of the MutL C-terminal domain 提交 2004-08-24 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
链 B 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;277 K;NaCl, Li2SO4, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.278
1X9Z Crystal structure of the MutL C-terminal domain 提交 2004-08-24 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
链 B 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;277 K;NaCl, Li2SO4, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.278
1X9Z Crystal structure of the MutL C-terminal domain 提交 2004-08-24 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;277 K;NaCl, Li2SO4, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.278
1X9Z Crystal structure of the MutL C-terminal domain 提交 2004-08-24 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 432–615(184 aa) 片段:C-terminal domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;277 K;NaCl, Li2SO4, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.278
5AKB MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 1 提交 2015-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
链 D 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 4.71 Å R-free 0.349
5AKB MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 1 提交 2015-03-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 4.71 Å R-free 0.349
5AKC MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 2 提交 2015-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
链 D 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 6.60 Å R-free 0.291
5AKC MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 2 提交 2015-03-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
链 H 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 6.60 Å R-free 0.291
5AKC MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 2 提交 2015-03-03 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 K 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
链 L 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 6.60 Å R-free 0.291
5AKD MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 3 提交 2015-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
链 D 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 7.60 Å R-free 0.306
5AKD MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 3 提交 2015-03-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
链 H 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 7.60 Å R-free 0.306
5AKD MutS in complex with the N-terminal domain of MutL - crystal form 3 提交 2015-03-03 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 K 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
链 L 1–349(349 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-349
突变:YES 突变:YES ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 9-12% PEG8000, 100 MM TRIS PH 7.0, 200 MM MGCL2, 80-450 MM SODIUM MALONATE
分辨率 7.60 Å R-free 0.306
7AIB MutS-MutL in clamp state 提交 2020-09-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 1–331(331 aa)
突变:N131C,C61S,C216L,C256F,C276Y ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging
分辨率 4.70 Å
7AIC MutS-MutL in clamp state (kinked clamp domain) 提交 2020-09-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 1–331(331 aa)
突变:N131C,C61S,C216L,C256F,C276Y ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging
分辨率 5.00 Å
7P8V The structure of E. coli MutL bound to a 3' resected DNA end 提交 2021-07-23 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–615(615 aa)
链 B 1–615(615 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9PRP N-terminal domain of E. coli MutL bound to NP660 提交 2025-07-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–349(349 aa)
未记录 A1CKR 5-(cyclopentyloxy)benzene-1,3-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;21% PEG3350, 200 mM ammonium tartrate, 100 mM Bis-Tris, pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.295
9PRP N-terminal domain of E. coli MutL bound to NP660 提交 2025-07-24 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–349(349 aa)
未记录 A1CKR 5-(cyclopentyloxy)benzene-1,3-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;295 K;21% PEG3350, 200 mM ammonium tartrate, 100 mM Bis-Tris, pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.295