当前蛋白身份：P24321
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1I94 CRYSTAL STRUCTURES OF THE SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT WITH TETRACYCLINE, EDEINE AND IF3 提交 2001-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 75 WO2 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；MPD, magnesium chloride, spermidine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.245 |
| 1I95 CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH EDEINE 提交 2001-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 75 WO2 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 EDE EDEINE B × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；MPD, magnesium chloride, spermidine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.244 |
| 1I96 CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH THE TRANSLATION INITIATION FACTOR IF3 (C-TERMINAL DOMAIN) 提交 2001-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 75 WO2 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 12 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；MPD, magnesium chloride, spermidine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.K
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.264 |
| 1I97 CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE 提交 2001-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 75 WO2 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TAC TETRACYCLINE × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；MPD, magnesium chloride, spermidine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.K
|
分辨率 4.50 Å R-free 0.254 |
| 1J5E Structure of the Thermus thermophilus 30S Ribosomal Subunit 提交 2002-04-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 188 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 277K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.252 |
| 1N32 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer RNA anticodon stem-loop mismatched at the first codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 158 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 1N33 Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit bound to codon and near-cognate transfer rna anticodon stem-loop mismatched at the second codon position at the a site with paromomycin 提交 2002-10-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 106 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, potassium-MES, sodium cacodylate,
PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.284 |
| 2E5L A snapshot of the 30S ribosomal subunit capturing mRNA via the Shine- Dalgarno interaction 提交 2006-12-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；10mM HEPES-KOH, 10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 6mM beta-mercaptoethanol, 11-12% MPD, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 2F4V 30S ribosome + designer antibiotic 提交 2005-11-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 101 K POTASSIUM ION × 12 D2C (2S,4S,4AR,5AS,6S,11R,11AS,12R,12AR)-7-CHLORO-4-(DIMETHYLAMINO)-6,10,11,12-TETRAHYDROXY-1,3-DIOXO-1,2,3,4,4A,5,5A,6,11,11A,12,12A-DODECAHYDROTETRACENE-2-CARBOXAMIDE × 1 AB9 (2R)-4-AMINO-N-{(1R,2S,3R,4R,5S)-5-AMINO-2-{2-[(2-AMINOETHYL)AMINO]ETHOXY}-4-[(2,6-DIAMINO-2,6-DIDEOXY-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL)OXY]-3-HYDROXYCYCLOHEXYL}-2-HYDROXYBUTANAMIDE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.80 Å R-free 0.315 |
| 2HHH Crystal structure of kasugamycin bound to the 30S ribosomal subunit 提交 2006-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
0–104（105 aa）
|
未记录 | KSG (1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；MPD, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, AMMONIUM CHLORIDE, MES-KOH, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.289 |
| 2VQE Modified uridines with C5-methylene substituents at the first position of the tRNA anticodon stabilize U-G wobble pairing during decoding 提交 2008-03-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 206 K POTASSIUM ION × 62 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；SEE WIMBERLY ET AL., NATURE 2000, pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 2VQF Modified uridines with C5-methylene substituents at the first position of the tRNA anticodon stabilize U-G wobble pairing during decoding 提交 2008-03-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 214 K POTASSIUM ION × 73 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；SEE WIMBERLY ET AL.,NATURE, 2000, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.258 |
| 2ZM6 Crystal structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit 提交 2008-04-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–105（104 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；10mM HEPES-KOH, 10mM MgCl2, 60mM NH4Cl, 6mM beta-mercaptoethanol, 11-12% MPD, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.323 |
| 3OTO Crystal Structure of the 30S ribosomal subunit from a KsgA mutant of Thermus thermophilus (HB8) 提交 2010-09-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 94 K POTASSIUM ION × 42 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 6.5；277 K；pH 6.5, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 3.69 Å R-free 0.231 |
| 3T1H Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit complexed with a human anti-codon stem loop (HASL) of transfer RNA lysine 3 (tRNALys3) bound to an mRNA with an AAA-codon in the A-site and Paromomycin 提交 2011-07-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 185 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.276 |
| 3T1Y Structure of the Thermus thermophilus 30S ribosomal subunit complexed with a human anti-codon stem loop (HASL) of transfer RNA Lysine 3 (TRNALYS3) bound to an mRNA with an AAG-codon in the A-site and paromomycin 提交 2011-07-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 186 PAR PAROMOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD, NH4Cl, KCl, CaCl2, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |
| 4AQY Structure of ribosome-apramycin complexes 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–104（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 203 K POTASSIUM ION × 15 AM2 APRAMYCIN × 5 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；MPD, NH4CL, KCL, CACL2, MAGNESIUM ACETATE, SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP AT 277K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.235 |
| 4V4R Crystal structure of the whole ribosomal complex. 提交 2005-09-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；277 K；PEG20k, MES buffer, magnesium acetate, potassium chloride, ammonium chloride, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 5.90 Å R-free 0.371 |
| 4V4S Crystal structure of the whole ribosomal complex. 提交 2005-10-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；277 K；PEG20k, MES buffer, magnesium acetate, potassium chloride, ammonium chloride, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 6.76 Å R-free 0.356 |
| 4V4T Crystal structure of the whole ribosomal complex with a stop codon in the A-site. 提交 2005-10-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 AQ
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；277 K；PEG20k, MES buffer, magnesium acetate, potassium chloride, ammonium chloride, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 6.46 Å R-free 0.361 |
| 4V4X Crystal structure of the 70S Thermus thermophilus ribosome showing how the 16S 3'-end mimicks mRNA E and P codons. 提交 2006-06-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 AT
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 5.00 Å R-free 0.323 |
| 4V4Y Crystal structure of the 70S Thermus thermophilus ribosome with translocated and rotated Shine-Dalgarno Duplex. 提交 2006-06-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 AT
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.326 |
| 4V4Z 70S Thermus thermophilous ribosome functional complex with mRNA and E- and P-site tRNAs at 4.5A. 提交 2006-06-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 AT
0–104（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 4.51 Å R-free 0.345 |
| 5IMQ Structure of ribosome bound to cofactor at 3.8 angstrom resolution 提交 2016-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–105（105 aa）
|
未记录 | GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Buffer G
5 mM HEPES pH 7.5, 10 mM MgAc, 50 mM KCl, 10 mM NH4Cl, and 6 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5IMR Structure of ribosome bound to cofactor at 5.7 angstrom resolution 提交 2016-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–105（105 aa）
|
未记录 | GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Buffer G
5 mM HEPES pH 7.5, 10 mM MgAc, 50 mM KCl, 10 mM NH4Cl, and 6 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 5WNQ Crystal Structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus 提交 2017-08-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–100（99 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 254 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6.5；298 K；17% MPD
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.245 |
| 5WNR Crystal Structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus 提交 2017-08-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–100（99 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 254 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6.5；298 K；17% MPD
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.256 |
| 5WNS Crystal Structure of 30S ribosomal subunit from Thermus thermophilus 提交 2017-08-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 Q
2–100（99 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 254 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6.5；298 K；17% MPD
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.255 |
| 5ZLU Ribosome Structure bound to ABC-F protein. 提交 2018-03-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–105（104 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7DUG Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N1''TFMS bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | HJR N-[(1R,2R,3R,4S,5R)-4-[(2R,6S)-6-(aminomethyl)oxan-2-yl]oxy-5-azanyl-2-[(2R,4S,5R}-5-methyl-4-(methylamino)-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-cyclohexyl]-1,1,1-tris(fluoranyl)methanesulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 249 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；17% MPD
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.225 |
| 7DUH Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N1''AC bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | HJO N-[(1R,2R,3R,4S,5S)-4-[(2R,3R,6S)-6-(aminomethyl)-3-azanyl-oxan-2-yl]oxy-5-azanyl-2-[(2R,3R,4R)-5-methyl-4-(methylamino)-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-cyclohexyl]ethanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 249 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；17% MPD
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.230 |
| 7DUI Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N1''PyrS bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | HKO N-[(1R,2R,3R,4S,5R)-4-[(2R,3R,6S)-6-(aminomethyl)-3-azanyl-oxan-2-yl]oxy-5-azanyl-2-[[(3S,4S,5S,6R)-5-(methylamino)-4,6-bis(oxidanyl)-2-oxabicyclo[4.1.0]heptan-3-yl]oxy]-3-oxidanyl-cyclohexyl]pyridine-3-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 249 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；17% MPD
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.213 |
| 7DUJ Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N1,3''Bz bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 249 SIS (1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-{[(2S,3R)-3-amino-6-(aminomethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-hydroxycyclohexyl 3-deoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-beta-L-arabinopyranoside × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；17% MPD
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.235 |
| 7DUK Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N1,3''MS bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 249 SIS (1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-{[(2S,3R)-3-amino-6-(aminomethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-hydroxycyclohexyl 3-deoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-beta-L-arabinopyranoside × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；17% MPD
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分辨率 3.60 Å R-free 0.228 |
| 7DUL Crystal structure of the Thermus thermophilus (HB8) 30S ribosomal subunit with mRNA and cognate transfer RNA anticodon stem-loop and sisomicin derivative N3''MS bound 提交 2021-01-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 249 SIS (1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-{[(2S,3R)-3-amino-6-(aminomethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-hydroxycyclohexyl 3-deoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-beta-L-arabinopyranoside × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；17% MPD
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.220 |
| 8WRC Time-Resolved Ambient Temperature Kineto-Crystallographic Structure of Initiation Factor in Complex with Ribosome 提交 2023-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 Q
1–105（105 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 254 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MPD
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分辨率 3.59 Å R-free 0.282 |