当前蛋白身份:P25025 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4MPA Crystal structure of NHERF1-CXCR2 signaling complex in P21 space group 提交 2013-09-12 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 356–360(5 aa) 片段:SEE REMARK 999
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.8;293 K;100 mM sodium acetate, pH 4.8, 0.2 M ammonium acetate, 24% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.10 Å R-free 0.157
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 356–360(5 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.44 Å R-free 0.195
4Q3H The crystal structure of NHERF1 PDZ2 CXCR2 complex revealed by the NHERF1 CXCR2 chimeric protein 提交 2014-04-11 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 356–360(5 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris HCl, pH 8.5, 8% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.44 Å R-free 0.195
5TYT Crystal Structure of the PDZ domain of RhoGEF bound to CXCR2 C-terminal peptide 提交 2016-11-21 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 356–360(5 aa) 片段:Rho (UNP residues 41-123), CXCR2 C-terminal peptide (UNP residues 356-360)
链 B 356–360(5 aa) 片段:Rho (UNP residues 41-123), CXCR2 C-terminal peptide (UNP residues 356-360)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;25% PEG8000, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M sodium acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
5TYT Crystal Structure of the PDZ domain of RhoGEF bound to CXCR2 C-terminal peptide 提交 2016-11-21 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 356–360(5 aa) 片段:Rho (UNP residues 41-123), CXCR2 C-terminal peptide (UNP residues 356-360)
链 D 356–360(5 aa) 片段:Rho (UNP residues 41-123), CXCR2 C-terminal peptide (UNP residues 356-360)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;25% PEG8000, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M sodium acetate
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
6KVA Structure of anti-hCXCR2 abN48-2 in complex with its CXCR2 epitope 提交 2019-09-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 9–19(11 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
6KVA Structure of anti-hCXCR2 abN48-2 in complex with its CXCR2 epitope 提交 2019-09-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 b 9–19(11 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
6KVF Structure of anti-hCXCR2 abN48 in complex with its CXCR2 epitope 提交 2019-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 b 9–19(11 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES sodium pH 7.5, 2% v/v Polyethylene glycol 400, 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.79 Å R-free 0.264
6KVF Structure of anti-hCXCR2 abN48 in complex with its CXCR2 epitope 提交 2019-09-04 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 9–19(11 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES sodium pH 7.5, 2% v/v Polyethylene glycol 400, 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.79 Å R-free 0.264
6LFL Crystal structure of a class A GPCR 提交 2019-12-03 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 37–241(205 aa)
链 A 244–344(101 aa)
突变:L135W, A249E, G303A 突变:L135W, A249E, G303A EBX 4-[[3,4-bis(oxidanylidene)-2-[[(1~{R})-1-(4-propan-2-ylfuran-2-yl)propyl]amino]cyclobuten-1-yl]amino]-~{N},~{N}-dimethyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;293 K;100mM HEPES pH7.0, 32% PEG 400, 50-150 mM Sodium tartrate dibasic dihydrate salt
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
6LFM Cryo-EM structure of a class A GPCR 提交 2019-12-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 R 1–360(360 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6LFO Cryo-EM structure of a class A GPCR monomer 提交 2019-12-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 1–360(360 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8XVU Structure of CXCR2 bound to CXCL2 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
8XWA Structure of CXCR2 bound to CXCL1 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8XWF Structure of CXCR2 bound to CXCL3 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
8XWM Structure of CXCR2 bound to CXCL6 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
8XWN Structure of CXCR2 bound to CXCL8 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8XWS Structure of CXCR2 bound to CXCL5 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 2–360(359 aa)
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8XWV Structure of CXCR2 bound to CXCL1 (CXCR2-CXCL1-Go Full map) 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8XX3 Structure of CXCR2 bound to CXCL3 (CXCR2-CXCL3-Go Full map) 提交 2024-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8XX6 Structure of CXCR2 bound to CXCL8 (CXCR2-CXCL8-Go Full map) 提交 2024-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
8XX7 Structure of CXCR2 bound to CXCL5 (CXCR2-CXCL5-Go Full map) 提交 2024-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 C 2–360(359 aa)
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
8XXH Structure of CXCR2 bound to CXCL2 (CXCR2-CXCL2-Go Full map) 提交 2024-01-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8XXR Structure of CXCR2 bound to CXCL6 (CXCR2-CXCL6-Go Full map) 提交 2024-01-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8XXX Structure of CXCR2 bound to CXCL6 (Composite map) 提交 2024-01-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 R 2–360(359 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å