当前蛋白身份：P25799
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BFS STRUCTURE OF NF-KB P50 HOMODIMER BOUND TO A KB SITE 提交 1997-09-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：DIMERIZATION DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.287 |
| 1IKN IKAPPABALPHA/NF-KAPPAB COMPLEX 提交 1998-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
245–363（119 aa）
片段：N-TERMINAL AND DIMERIZATION DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；pH 7.00
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 1LE5 Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to an IFNb-kB 提交 2002-04-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–350（312 aa）
片段：p50 RHR
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；50 mM Na acatate, 50mM CaCl2, 1.0 mM Na spermine, 8% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.293 |
| 1LE5 Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to an IFNb-kB 提交 2002-04-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
39–350（312 aa）
片段：p50 RHR
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；50 mM Na acatate, 50mM CaCl2, 1.0 mM Na spermine, 8% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.293 |
| 1LE9 Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to the Ig/HIV-kB siti 提交 2002-04-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–350（312 aa）
片段：p50 RHR
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；PEG 3350, CaCl2, Na acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 110K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.305 |
| 1LE9 Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to the Ig/HIV-kB siti 提交 2002-04-09 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
39–350（312 aa）
片段：p50 RHR
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；PEG 3350, CaCl2, Na acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 110K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.305 |
| 1LEI The kB DNA sequence from the HLV-LTR functions as an allosteric regulator of HIV transcription 提交 2002-04-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–350（312 aa）
片段：p50 RHR
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
SMALL TUBES；pH 6.5；291 K；PEG 3350, CaCl2, sodium spermine, pH 6.5, SMALL TUBES, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.284 |
| 1NFK STRUCTURE OF THE NUCLEAR FACTOR KAPPA-B (NF-KB) P50 HOMODIMER 提交 1995-02-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
39–363（325 aa）
链 B
39–363（325 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.340 |
| 1OOA CRYSTAL STRUCTURE OF NF-kB(p50)2 COMPLEXED TO A HIGH-AFFINITY RNA APTAMER 提交 2003-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
39–363（325 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, ethylene glycol, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.248 |
| 1OOA CRYSTAL STRUCTURE OF NF-kB(p50)2 COMPLEXED TO A HIGH-AFFINITY RNA APTAMER 提交 2003-03-03 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–363（325 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, ethylene glycol, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.248 |
| 1U36 Crystal structure of WLAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：Y267W, V310C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.220 |
| 1U3J Crystal structure of MLAV mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：Y267M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 1U3Y Crystal structure of ILAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：Y267I, V310C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.223 |
| 1U3Z Crystal structure of MLAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：Y267M, V310C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 1U41 Crystal structure of YLGV mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
链 B
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：A308G 突变：A308G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 1U41 Crystal structure of YLGV mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
链 D
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：A308G 突变：A308G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 1U42 Crystal structure of MLAM mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor 提交 2004-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–350（106 aa）
片段：dimerization domain
|
突变：Y267M, V310M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；PEG 8000, ammonium sulphate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.317 |
| 1VKX CRYSTAL STRUCTURE OF THE NFKB P50/P65 HETERODIMER COMPLEXED TO THE IMMUNOGLOBULIN KB DNA 提交 1997-09-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–350（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；pH 5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 2I9T Structure of NF-kB p65-p50 heterodimer bound to PRDII element of B-interferon promoter 提交 2006-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
39–350（312 aa）
片段：residues 39-350
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；293 K；8% PEG 5K monomethylether, 200mM sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 5.60
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.288 |
| 2V2T X-ray structure of a NF-kB p50-RelB-DNA complex 提交 2007-06-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
38–363（326 aa）
片段：NUCLEAR FACTOR NF-KAPPA-B P50 SUBUNIT, RESIDUES 38-363
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；5% PEG3350 100 MM NACITRATE 1MM SPERMINE 5MM DTT, pH 7
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分辨率 3.05 Å R-free 0.276 |
| 3JV4 Crystal structure of the dimerization domains p50 and RelB 提交 2009-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
245–359（115 aa）
片段：dimerization domain (UNP residues 245-359)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG8000, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.280 |
| 3JV4 Crystal structure of the dimerization domains p50 and RelB 提交 2009-09-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
245–359（115 aa）
片段：dimerization domain (UNP residues 245-359)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG8000, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.280 |
| 3JV4 Crystal structure of the dimerization domains p50 and RelB 提交 2009-09-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
245–359（115 aa）
片段：dimerization domain (UNP residues 245-359)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG8000, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.280 |
| 8TKL Murine NF-kappaB p50 Rel Homology Region homodimer in complex with a Test 16-mer kappaB-like DNA 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
39–350（312 aa）
链 B
39–350（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；4% Tacsimate pH 6.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.284 |
| 8TKM Murine NF-kappaB p50 Rel Homology Region homodimer in complex with 17-mer kappaB DNA from human interleukin-6 (IL-6) promoter 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
39–350（312 aa）
链 B
39–350（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M Na-Acetate pH 4.9, 16% (w/v) PEG 1500
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 8TKN Murine NF-kappaB p50 Rel Homology Region homodimer in complex with 10-mer kappaB DNA from human Neutrophil Gelatinase-associated Lipocalin (NGAL) promoter 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
39–350（312 aa）
链 B
39–350（312 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；0.05 M sodium acetate pH 5.4, 20 mM magnesium sulfate, and 4% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.288 |
| 9BOR IkappaBzeta ankyrin repeat domain:NF-kappaB p50 homodimer complex at 2.0 Angstrom resolution 提交 2024-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
245–376（132 aa）
链 C
245–376（132 aa）
|
未记录 | HT3 (2R,3S)-heptane-1,2,3-triol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303 K；20mM acetic acid pH 5.2, 80mM acetic acid pH 5.8, 5.5% PEG 3350, 10mM DTT, 0.5% 1,2,3 heptanetriol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |