当前蛋白身份：P29374
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LCC Solution structure of RBBP1 chromobarrel domain 提交 2011-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
568–635（68 aa）
片段：UNP RESIDUES 568-635
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.4；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 15N] entity-1, 50 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 5 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] entity-5, 50 mM sodium phosphate-6, 50 mM sodium chloride-7, 5 mM DTT-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2MAM Solution structure of the interdigitated double Tudor domain of RBBP1 提交 2013-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–121（118 aa）
片段：UNP RESIDUES 4-121
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] entity-1, 10 % [U-99% 2H] D2O-2, 0.0004 % DSS-3, 15 mM DTT-4, 50 mM sodium chloride-5, 50 mM TRIS-6, 2 mM EDTA-7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2YRV Solution structure of the RBB1NT domain of human RB(retinoblastoma)-binding protein 1 提交 2007-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
170–273（104 aa）
片段：UNP region 170-273
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.2mM sample U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6BPH Crystal structure of the chromodomain of RBBP1 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
568–635（68 aa）
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 34 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5
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分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 6L87 Solution structure of the tandem PWWP-ARID domains of human RBBP1 提交 2019-11-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
171–414（244 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；302 K；离子强度（mmCIF原始值）720；压力 1
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 700 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM sodium phosphate, 700 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7SMC p107 pocket domain complexed with ARID4A peptide 提交 2021-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
953–967（15 aa）
片段：UNP residues 953-967
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.298 |
| 7SMC p107 pocket domain complexed with ARID4A peptide 提交 2021-10-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
953–967（15 aa）
片段：UNP residues 953-967
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.298 |
| 7V8N Crystal structure of the PWWP-ARID domain of ARID4A 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
169–417（249 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1 M Tris pH8.0
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分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 7V8N Crystal structure of the PWWP-ARID domain of ARID4A 提交 2021-08-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
169–417（249 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1 M Tris pH8.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |