当前蛋白身份：P29395
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EG0 FITTING OF COMPONENTS WITH KNOWN STRUCTURE INTO AN 11.5 A CRYO-EM MAP OF THE E.COLI 70S RIBOSOME 提交 2000-02-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM Hepes, 6 mM Mg(CH3COO)2 150 mM NH4Cl, 4 mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 11.50 Å |
| 1JQM Fitting of L11 protein and elongation factor G (EF-G) in the cryo-em map of e. coli 70S ribosome bound with EF-G, GDP and fusidic acid 提交 2001-08-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
|
分辨率 18.00 Å |
| 1JQS Fitting of L11 protein and elongation factor G (domain G' and V) in the cryo-em map of E. coli 70S ribosome bound with EF-G and GMPPCP, a nonhydrolysable GTP analog 提交 2001-08-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 18.00 Å |
| 1JQT Fitting of L11 protein in the low resolution cryo-EM map of E.coli 70S ribosome 提交 2001-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 18.00 Å |
| 1MMS Crystal structure of the ribosomal PROTEIN L11-RNA complex 提交 1999-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–140（140 aa）
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未记录 | CD CADMIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 10 MMC METHYL MERCURY ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；25% GLYCEROL, 15% PEG 4000, 50 MM TRIS PH 7.5, 50 MM MGCL2, 20 MM CDCL2, 0.2 M
KCL, 1 MM DITHIOTHREITOL, 4 DEGREES C, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.254 |
| 1MMS Crystal structure of the ribosomal PROTEIN L11-RNA complex 提交 1999-04-14 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–140（140 aa）
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未记录 | CD CADMIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 9 MMC METHYL MERCURY ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；25% GLYCEROL, 15% PEG 4000, 50 MM TRIS PH 7.5, 50 MM MGCL2, 20 MM CDCL2, 0.2 M
KCL, 1 MM DITHIOTHREITOL, 4 DEGREES C, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.254 |
| 1MVR Decoding Center & Peptidyl transferase center from the X-ray structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome, aligned to the low resolution Cryo-EM map of E.coli 70S Ribosome 提交 2002-09-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–140（140 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
polymix buffer；pH 7.5；polymix buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane
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分辨率 12.80 Å |
| 1OLN Model for thiostrepton antibiotic binding to L11 substrate from 50S ribosomal RNA 提交 2003-08-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–141（140 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
NMR测量条件
pH 6.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）100 MM NACL, 5 MM MGCL2；压力 1
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分辨率未提供 |
| 1PN7 Coordinates of S12, L11 proteins and P-tRNA, from the 70S X-ray structure aligned to the 70S Cryo-EM map of E.coli ribosome 提交 2003-06-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 L
7–139（133 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane
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分辨率 10.80 Å |
| 1PN8 Coordinates of S12, L11 proteins and E-site tRNA from 70S crystal structure separately fitted into the Cryo-EM map of E.coli 70S.EF-G.GDPNP complex. The atomic coordinates originally from the E-site tRNA were fitted in the position of the hybrid P/E-site tRNA. 提交 2003-06-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 L
7–139（133 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane
|
分辨率 10.80 Å |
| 1R2W Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of the 70S ribosome 提交 2003-09-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
Polymix buffer；pH 7.5；Polymix buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid freezing in liquid ethane
|
分辨率 9.00 Å |
| 1R2X Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome 提交 2003-09-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
Polymix buffer；pH 7.5；Polymix buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid freezing in liquid ethane
|
分辨率 9.00 Å |
| 2BCW Coordinates of the N-terminal domain of ribosomal protein L11,C-terminal domain of ribosomal protein L7/L12 and a portion of the G' domain of elongation factor G, as fitted into cryo-em map of an Escherichia coli 70S*EF-G*GDP*fusidic acid complex 提交 2005-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
7–71（65 aa）
片段：N-terminal domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine；pH 7.5；20mM HEPES-KOH (pH 7.5), 6mM MgCl2, and 150 mM NH4Cl, 2mM spermidine, 0.4 mM spermine
cryo-EM玻璃化条件
RAPID-FREEZING IN LIQUID ETHANE
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分辨率 11.20 Å |
| 2JQ7 Model for thiostrepton binding to the ribosomal L11-RNA 提交 2007-05-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–141（141 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）220；压力 1
NMR样品组成
0.3 MM [U-13C, U-15N U-2H] RIBOSOMAL PROTEIN L11, 0.3 MM RIBOSOMAL RNA, 0.3 MM THIOSTREPTON ANTIBIOTIC, 20 MM POTASSIUM PHOSPHATE, 200 MM POTASSIUM CHLORIDE, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 2K3F Ribosomal protein L11 from Thermotoga maritima 提交 2008-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–141（141 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 15N] L11, 20 mM potassium phosphate, 50 mM potassium chloride, 10 % [U-100% 2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 487D SEVEN RIBOSOMAL PROTEINS FITTED TO A CRYO-ELECTRON MICROSCOPIC MAP OF THE LARGE 50S SUBUNIT AT 7.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2000-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 L
8–140（133 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 7.50 Å |
| 4V42 Crystal structure of the ribosome at 5.5 A resolution. 提交 2001-03-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致 |
链 BL
1–141（141 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 5.50 Å |