当前蛋白身份：P30130
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZDV Solution Structure of the type 1 pilus assembly platform FimD(25-139) 提交 2005-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
70–184（115 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN Residues 70-184
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；压力 ambient
NMR样品组成
Uniform labeling with 13C, 15N; 90 % H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZDX Solution Structure of the type 1 pilus assembly platform FimD(25-125) 提交 2005-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
70–170（101 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN Residues 70-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；压力 ambient
NMR样品组成
Uniform labeling with 13C, 15N; 90 % H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZE3 Crystal Structure of the Ternary Complex of FIMD (N-Terminal Domain) with FIMC and the Pilin Domain of FIMH 提交 2005-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
46–170（125 aa）
片段：FimD N-terminal domain
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 6000, MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.84 Å R-free 0.217 |
| 3BWU Crystal structure of the ternary complex of FimD (N-Terminal Domain, FimDN) with FimC and the N-terminally truncated pilus subunit FimF (FimFt) 提交 2008-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
46–170（125 aa）
片段：N-terminal domain, Residues 1-125
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 mM Tris/HCl pH 8.0, 20% PEG 8000, 50 mM succinic acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 4J3O Crystal structure of the FimD usher traversed by the pilus tip complex assembly composed of FimC:FimF:FimG:FimH 提交 2013-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
片段：UNP residues 46-878
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.6-2.0M sodium formate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.80 Å R-free 0.299 |
| 7B0X Crystal structure of the ternary complex of the E. coli type 1 pilus proteins FimC, FimI and the N-terminal domain of FimD 提交 2020-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
46–170（125 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Hepes pH 8.4, 15 % PEG 4000
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分辨率 1.70 Å R-free 0.252 |
| 9BOG Structural basis for adhesin secretion by the outer-membrane usher in type 1 pili 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.99 Å |
| 9FW9 Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnC - body 2) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.90 Å |
| 9FWB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn and FimAn-1) 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9FWZ Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn, FimAn-1 and FimAn-2) 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9FX8 Cryo-EM structure of the FimI-bound type 1 pilus assembly platform complex - Local refinement 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9FXB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimI-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnIC - body 2) 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9FXS Cryo-EM structure of the type 1 pilus complex including pilus rod and FimI-bound assembly platform after incorporation of two FimI subunits - Local refinement 提交 2024-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9FY9 Cryo-EM structure of the type 1 chaperone-usher pilus FimD-tip complex (FimDHGFC) - Conformer 1 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
46–878（833 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |