当前蛋白身份：P32597
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6K15 RSC substrate-recruitment module 提交 2019-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 J
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6KMB Crystal structure of Sth1 bromodomain 提交 2019-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 6KMB Crystal structure of Sth1 bromodomain 提交 2019-07-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 6KMB Crystal structure of Sth1 bromodomain 提交 2019-07-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 6KMB Crystal structure of Sth1 bromodomain 提交 2019-07-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium formate, pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 6KMJ Crystal structure of Sth1 bromodomain in complex with H3K14Ac 提交 2019-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.188 |
| 6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–1359（1359 aa）
链 W
1–1359（1359 aa）
链 Y
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.13 Å |
| 6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–1359（1359 aa）
链 V
1–1359（1359 aa）
链 Y
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.55 Å |
| 6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric（28） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–1359（1359 aa）
链 P
1–1359（1359 aa）
链 Q
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.13 Å |
| 6LQZ Solution structure of Taf14ET-Sth1EBMC 提交 2020-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1183–1240（58 aa）
片段：Sth1EBMC
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taf14ET, 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Sth1EBMC, 20 mM Phosphate buffer, 100 mM sodium chloride, 1 % v/v inhabitor cocktail, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1250–1359（110 aa）
链 F
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6MR4 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from S.cerevisiae 提交 2018-10-11 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1250–1359（110 aa）
链 E
1250–1359（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate
0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
3% Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.270 |
| 6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 15.00 Å |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6UY1 Crystal structure of the Sth1 bromodomain from Saccharomyces cerevisiae at 2.2 Angstrom resolution 提交 2019-11-09 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1250–1359（110 aa）
片段：bromodomain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
0.2 M magnesium chloride hexahydrate
25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.228 |
| 6V8O RSC core 提交 2019-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 R
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–1359（1359 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 20.00 Å |
| 6VZ4 Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 bound to the nucleosome in ADP Beryllium Fluoride state 提交 2020-02-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 K
301–1097（797 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20
|
分辨率 3.90 Å |
| 6VZG Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
301–1097（797 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20
|
分辨率 4.20 Å |
| 7F3S Crystal structure of Sth1 Bromodomain in complex with H3K14bz peptide 提交 2021-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1248–1359（112 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；289 K；25% (w/v) PEG 1500, 0.1M MIB/Hydrochloric acid
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |