当前蛋白身份:P33778
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 D
2–126(125 aa)
链 H
2–126(125 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.270 |
| 3X1U Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variants involved in reprogramming 提交 2014-11-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 D
3–126(124 aa)
链 H
3–126(124 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.270 |
| 9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 O
1–126(126 aa)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.28 Å |
| 9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 D
1–126(126 aa)
链 H
1–126(126 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.50 Å |
| 9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致 |
链 T
33–124(92 aa)
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.35 Å |