当前蛋白身份:P35225
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GA3 NMR STRUCTURE OF INTERLEUKIN-13 提交 2000-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
35–146(112 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] IL-13, 25 mM phosphate buffer, 50 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1IJZ Solution Structure of Human IL-13 提交 2001-05-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
21–132(112 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl; 100% D2O; pH 6.0 | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 1IK0 Solution Structure of Human IL-13 提交 2001-05-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
21–132(112 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl; 100% D2O; pH 6.0 | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 3G6D Crystal structure of the complex between CNTO607 Fab and IL-13 提交 2009-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
21–132(112 aa)
片段:UNP residues 21-132
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5;293 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 4.9 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.263 |
| 3G6D Crystal structure of the complex between CNTO607 Fab and IL-13 提交 2009-02-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
21–132(112 aa)
片段:UNP residues 21-132
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5;293 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 4.9 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.263 |
| 3L5W Crystal structure of the complex between IL-13 and C836 FAB 提交 2009-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
35–146(112 aa)
片段:UNP residues 35-146
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES PH 7.5, 20% PEG 3350, 0.2 M SODIUM TARTRATE; CRYO CONDITIONS: MOTHER LIQUOR + 18% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 3L5W Crystal structure of the complex between IL-13 and C836 FAB 提交 2009-12-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 J
35–146(112 aa)
片段:UNP residues 35-146
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES PH 7.5, 20% PEG 3350, 0.2 M SODIUM TARTRATE; CRYO CONDITIONS: MOTHER LIQUOR + 18% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 3L5X Crystal structure of the complex between IL-13 and H2L6 FAB 提交 2009-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
35–146(112 aa)
片段:UNP residues 35-146
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 14% PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM TARTRATE. CRYO CONDITIONS: 0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG 3K, 0.2 M AMM TARTRATE, 15% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 3LB6 The structure of IL-13 in complex with IL-13Ralpha2 提交 2010-01-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
15–146(132 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;100 mM MES, pH 6.0, 200 mM CaCl2, 20% PEG-6000, and 4% v/v polypropylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.269 |
| 3LB6 The structure of IL-13 in complex with IL-13Ralpha2 提交 2010-01-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
15–146(132 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;100 mM MES, pH 6.0, 200 mM CaCl2, 20% PEG-6000, and 4% v/v polypropylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.269 |
| 4I77 Lebrikizumab Fab bound to IL-13 提交 2012-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 Z
35–146(112 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;15% w/v PEG1000, 0.05 M sodium malonate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.219 |
| 4PS4 Crystal structure of the complex between IL-13 and M1295 FAB 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
35–146(112 aa)
片段:UNP RESIDUES 35-146
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.5, 25% PEG 8K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 5E4E Engineered Interleukin-13 bound to receptor 提交 2015-10-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
34–146(113 aa)
片段:UNP residues 34-146
|
突变:L10V, V18I, L39R, D87S, T88S, L101F, K104R, K105T | SO4 SULFATE ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;293 K;lithium sulfate, phosphate/citrate pH 4.2, PEG 1000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.288 |
| 5L6Y il13 in complex with tralokinumab 提交 2016-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
35–146(112 aa)
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;sodium formate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.211 |