当前蛋白身份:P35225 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1GA3 NMR STRUCTURE OF INTERLEUKIN-13 提交 2000-11-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 35–146(112 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] IL-13, 25 mM phosphate buffer, 50 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1IJZ Solution Structure of Human IL-13 提交 2001-05-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 21–132(112 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl; 100% D2O; pH 6.0 | 100% D2O
分辨率未提供
1IK0 Solution Structure of Human IL-13 提交 2001-05-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 21–132(112 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40 mM sodium phosphate, 2 mM NaN3, 40 mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl 90% H2O, 10% D2O; pH 6.0 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM interleukin-13 U-15N,U-13C; 40mM phosphate buffer; 2mM NaN3; 40 mM NaCl; 100% D2O; pH 6.0 | 100% D2O
分辨率未提供
3G6D Crystal structure of the complex between CNTO607 Fab and IL-13 提交 2009-02-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 21–132(112 aa) 片段:UNP residues 21-132
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;293 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 4.9 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
3G6D Crystal structure of the complex between CNTO607 Fab and IL-13 提交 2009-02-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 21–132(112 aa) 片段:UNP residues 21-132
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;293 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 4.9 M Sodium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.263
3L5W Crystal structure of the complex between IL-13 and C836 FAB 提交 2009-12-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 35–146(112 aa) 片段:UNP residues 35-146
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES PH 7.5, 20% PEG 3350, 0.2 M SODIUM TARTRATE; CRYO CONDITIONS: MOTHER LIQUOR + 18% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
3L5W Crystal structure of the complex between IL-13 and C836 FAB 提交 2009-12-22 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 J 35–146(112 aa) 片段:UNP residues 35-146
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES PH 7.5, 20% PEG 3350, 0.2 M SODIUM TARTRATE; CRYO CONDITIONS: MOTHER LIQUOR + 18% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
3L5X Crystal structure of the complex between IL-13 and H2L6 FAB 提交 2009-12-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 35–146(112 aa) 片段:UNP residues 35-146
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 14% PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM TARTRATE. CRYO CONDITIONS: 0.1 M MES PH 6.5, 20% PEG 3K, 0.2 M AMM TARTRATE, 15% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.247
3LB6 The structure of IL-13 in complex with IL-13Ralpha2 提交 2010-01-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 15–146(132 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;100 mM MES, pH 6.0, 200 mM CaCl2, 20% PEG-6000, and 4% v/v polypropylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.05 Å R-free 0.269
3LB6 The structure of IL-13 in complex with IL-13Ralpha2 提交 2010-01-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 15–146(132 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;100 mM MES, pH 6.0, 200 mM CaCl2, 20% PEG-6000, and 4% v/v polypropylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.05 Å R-free 0.269
4I77 Lebrikizumab Fab bound to IL-13 提交 2012-11-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 Z 35–146(112 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;15% w/v PEG1000, 0.05 M sodium malonate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.219
4PS4 Crystal structure of the complex between IL-13 and M1295 FAB 提交 2014-03-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 35–146(112 aa) 片段:UNP RESIDUES 35-146
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.5, 25% PEG 8K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5E4E Engineered Interleukin-13 bound to receptor 提交 2015-10-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 34–146(113 aa) 片段:UNP residues 34-146
突变:L10V, V18I, L39R, D87S, T88S, L101F, K104R, K105T SO4 SULFATE ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;293 K;lithium sulfate, phosphate/citrate pH 4.2, PEG 1000
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
5L6Y il13 in complex with tralokinumab 提交 2016-06-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 35–146(112 aa)
未记录 FMT FORMIC ACID × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;sodium formate
分辨率 1.99 Å R-free 0.211