当前蛋白身份：P36070
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3TJ1 Crystal Structure of RNA Polymerase I Transcription Initiation Factor Rrn3 提交 2011-08-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–627（627 aa）
链 B
1–627（627 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 3350, 250 mM sodium-potassium-tartrate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.85 Å R-free 0.242 |
| 5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 O
1–627（627 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
|
分辨率 4.80 Å |
| 5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 O
1–627（627 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.70 Å |
| 5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 O
1–627（627 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.70 Å |
| 5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |
| 5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6RQT RNA Polymerase I-tWH-Rrn3-DNA 提交 2019-05-16 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–627（627 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |