当前蛋白身份：P37173
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KTZ Crystal Structure of the Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain in Complex with TGF-beta3 提交 2002-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
38–159（122 aa）
片段：Extracellular Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
HANGING DROP VAPOR DIFFUSION USING A WELL SOLUTION CONTAINING 20% (V/V) 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL AND 0.1 M CITRATE PH 4.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.215 |
| 1M9Z CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TGF-BETA TYPE II RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN 提交 2002-07-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
49–159（111 aa）
片段：Extracellular
|
突变：Q26A,K97T | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 2000, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.166 |
| 1PLO TRANSFORMING GROWTH FACTOR-BETA TYPE II RECEPTOR EXTRACELLULAR DOMAIN 提交 2003-06-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–159（122 aa）
|
突变：N19A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl, pH 5.5；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.1；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 5.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 99.99% D2O | 99.99% D2O
NMR样品组成
1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PJY Structural basis for cooperative assembly of the TGF-beta signaling complex 提交 2007-04-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
42–149（108 aa）
片段：extracellular domain
|
突变：N42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10-20% PEG 3350, 0.4-0.65 M calcium acetate, 0.1-0.25M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.297 |
| 3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
链 F
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
链 H
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
链 F
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
链 G
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
链 H
38–153（116 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 4P7U Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with NDSB-201 提交 2014-03-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
75–184（110 aa）
片段：extracellular domain, UNP residues 74-175
|
突变：Q26A K97T | 1PS 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.206 |
| 4XJJ Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with 2-(2-Hydroxyethyl)NDSB-201 提交 2015-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
50–159（110 aa）
片段：ligand binding domain (UNP reisudes 50-159)
|
突变：K97T | 41D 3-[2-(2-hydroxyethyl)pyridinium-1-yl]propane-1-sulfonate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 5E8V TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) 提交 2015-10-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
|
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.219 |
| 5E8Y TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
|
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A | STU STAUROSPORINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.227 |
| 5E91 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6-[4-(2- HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL] PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
|
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A | 5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.242 |
| 5E92 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH AMPPNP 提交 2015-10-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
|
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.231 |
| 5QIN TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH N- {4-[3-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2- YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
|
未记录 | J2V N-{4-[3-(6-methoxypyridin-3-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 5TX4 Derivative of mouse TGF-beta2, with a deletion of residues 52-71 and K25R, R26K, L51R, A74K, C77S, L89V, I92V, K94R T95K, I98V single amino acid substitutions, bound to human TGF-beta type II receptor ectodomain residues 15-130 提交 2016-11-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–153（116 aa）
片段：UNP residues 38-153
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Hepes, pH 7.5, 60 % v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.222 |
| 5TY4 MicroED structure of a complex between monomeric TGF-b and its receptor, TbRII, at 2.9 A resolution 提交 2016-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
72–174（103 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 ul 20 mg/mL protein + 0.25 ul mother liquor + 0.2 ul seed stock in 100 mM HEPES/NaOH pH 7.5, 45% MPD
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.328 |
| 7DV6 Discovery of Functionally Selective Transforming Growth Factor beta Type II Receptor (TGF-beta RII) Inhibitors as Anti-Fibrosis Agents 提交 2021-01-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
|
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A | HJF 5-[(3S)-5,5-dimethyloxolan-3-yl]-6-methoxy-3-(2-methoxypyridin-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；12-22% PEG4000,3% Ethylene Glycol,16% glycerol, 160 mM MgCl2, 80 mM TrisHCl at pH 7.5-9.3,The 9.2 mg/mL of TGFbetaRII protein was incubated with 1mM compound at 277K for 1-2 hr
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.224 |
| 8G4K Complex of TbRII mini protein binder bound to the TbRII ECD 提交 2023-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
46–155（110 aa）
片段：ECD (UNP residues 46-155)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；300 K；20% PEG5000 MME, 0.2-0.4 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.4, 16-32% glycerol
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.196 |
| 8YGZ The Crystal Structure of TGF beta R2 kinase domain from Biortus. 提交 2024-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
237–549（313 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 30% PEG4,000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–153（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.278 |
| 9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
42–153（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.278 |
| 9E9G Heligmosomoides polygyrus TGF-beta Mimic 6 Domain 3 (TGM6-D3) Bound to Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
38–154（117 aa）
片段：UNP residues 38-154
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 5 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 25% w/v PEG4000, pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |
| 9FDY Betaglycan Orphan Domain (ratBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–153（112 aa）
链 E
42–153（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–153（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9FKP Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–153（112 aa）
链 E
42–153（112 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |