当前蛋白身份：P38181
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3I5P Nup170(aa979-1502), S.cerevisiae 提交 2009-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
980–1502（523 aa）
片段：HELICAL DOMAIN (UNP residues 980-1502)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；289 K；0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, 8% PEG 3350, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.324 |
| 3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.272 |
| 3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.272 |
| 3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
链 B
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.272 |
| 3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
链 B
1253–1502（250 aa）
片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.272 |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric（240） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
|
分辨率 37.00 Å |
| 7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 D
1–1502（1502 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.71 Å |
| 7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 D
1–1502（1502 aa）
链 P
1–1502（1502 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.73 Å |
| 8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric（46） 与蛋白数一致 |
链 0
1–1502（1502 aa）
链 Y
1–1502（1502 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |