当前蛋白身份:P40064 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4MHC Crystal Structure of a Nucleoporin 提交 2013-08-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 70–893(824 aa) 片段:N-terminal domain (UNP residues 70-893)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;5% PEG 4,000, 0.1 M MES, pH 6.0, 0.05 M Magnesium chloride, 3% (v/v) 1,4-dioxane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 240 PDB 声明:240-meric(240) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:30-meric(30) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 448 PDB 声明:448-meric(448) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:56-meric(56) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å
7N9F Structure of the in situ yeast NPC 提交 2021-06-17 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:56-meric(56) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich)
分辨率 37.00 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 C 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 C 1–1391(1391 aa)
链 O 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:46-meric(46) 与蛋白数一致
链 1 1–1391(1391 aa)
链 Z 1–1391(1391 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å