当前蛋白身份:P40357 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 433–499(67 aa) 片段:Residues 433-499
链 D 589–650(62 aa) 片段:Residues 589-650
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.25;298 K;100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 G 433–499(67 aa) 片段:Residues 433-499
链 H 589–650(62 aa) 片段:Residues 589-650
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.25;298 K;100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.248
3B5N Structure of the yeast plasma membrane SNARE complex 提交 2007-10-26 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 K 433–499(67 aa) 片段:Residues 433-499
链 L 589–650(62 aa) 片段:Residues 589-650
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.25;298 K;100 mM MES pH 6.25, 30 % MPD, 200 mM Sodium bromide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.248
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa) 片段:t-SNARE coiled-coil homology domains
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa) 片段:t-SNARE coiled-coil homology domains
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa) 片段:t-SNARE coiled-coil homology domains
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa) 片段:t-SNARE coiled-coil homology domains
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa) 片段:t-SNARE coiled-coil homology domains
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9NLZ Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 8 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 L 433–650(218 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å