当前蛋白身份:P41091 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
28ZU human 48S PIC with Kozak mRNA and eIF1A W70A mutant 提交 2026-03-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:41-meric(41) 与全部聚合物一致
链 E 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
28ZV human 48S PIC with mRNA (non-Kozak) 提交 2026-03-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:41-meric(41) 与全部聚合物一致
链 E 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
28ZX human 48S PIC with mRNA (Kozak_1) 提交 2026-03-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致
链 E 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
28ZY human 48S PIC with mRNA (Kozak_2) 提交 2026-03-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致
链 E 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
6FEC Human cap-dependent 48S pre-initiation complex 提交 2017-12-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致
链 S 39–460(422 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris HCl, 50 mM KOAc, 2.5 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.25 mM spermidine 0.25 mM GMPPNP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
6K71 eIF2 - eIF2B complex 提交 2019-06-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 P 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6K72 eIF2(aP) - eIF2B complex 提交 2019-06-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 P 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6O81 Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to translation initiation factor 2 from Homo sapiens 提交 2019-03-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 S 1–472(472 aa)
链 T 1–472(472 aa)
未记录 C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
6O85 Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to eukaryotic translation initiation factor 2 from Homo sapiens 提交 2019-03-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 S 1–472(472 aa)
未记录 C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
6YBV Structure of a human 48S translational initiation complex - eIF2-TC 提交 2020-03-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ZP4 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2 提交 2020-07-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 Y 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7A09 Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State III 提交 2020-08-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 Y 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7D43 eIF2B-eIF2(aP), aPg complex 提交 2020-09-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 P 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7F66 eIF2B-SFSV NSs-1-eIF2 提交 2021-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 S 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7F67 eIF2B-SFSV NSs-2-eIF2 提交 2021-06-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 S 1–472(472 aa)
链 T 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
7QP6 Structure of the human 48S initiation complex in open state (h48S AUG open) 提交 2022-01-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:53-meric(53) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT, 0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cryo-EM grids were prepared by floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
分辨率 4.70 Å
7QP7 Structure of the human 48S initiation complex in closed state (h48S AUG closed) 提交 2022-01-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5, 95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT, 0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Cryo-EM grids were prepared by floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
分辨率 3.70 Å
8OZ0 Structure of a human 48S translation initiation complex with eIF4F and eIF4A 提交 2023-05-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 E 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PHD Structure of Human Cdc123 bound to domain 3 of eIF2 gamma and ATP 提交 2023-06-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 363–472(110 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% PEG3350 0.2 M lithium citrate 1 mM ATP 5 mM MgCl2
分辨率 2.08 Å R-free 0.205
8PHD Structure of Human Cdc123 bound to domain 3 of eIF2 gamma and ATP 提交 2023-06-19 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 363–472(110 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% PEG3350 0.2 M lithium citrate 1 mM ATP 5 mM MgCl2
分辨率 2.08 Å R-free 0.205
8PHV Structure of Human selenomethionylated Cdc123 bound to domain 3 of eIF2 gamma 提交 2023-06-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 363–472(110 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% PEG3350, 8% tacsimate
分辨率 1.97 Å R-free 0.222
8PHV Structure of Human selenomethionylated Cdc123 bound to domain 3 of eIF2 gamma 提交 2023-06-20 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 363–472(110 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% PEG3350, 8% tacsimate
分辨率 1.97 Å R-free 0.222
8PJ1 Structure of human 48S translation initiation complex in open codon scanning state (48S-1) 提交 2023-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 90 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
分辨率 3.40 Å
8PJ2 Structure of human 48S translation initiation complex in AUG recognition state after eIF5-induced GTP hydrolysis by eIF2 (48S-2) 提交 2023-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:49-meric(49) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
分辨率 3.40 Å
8PJ3 Structure of human 48S translation initiation complex upon transfer of initiator tRNA to eIF5B (48S-3) 提交 2023-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 89 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
分辨率 3.70 Å
8PJ4 Structure of human 48S translation initiation complex after eIF5 release (48S-4) 提交 2023-06-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:53-meric(53) 与全部聚合物一致
链 t 1–472(472 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 89 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
分辨率 3.20 Å
8PPL MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex 提交 2023-07-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 It 1–472(472 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 116 MET METHIONINE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 129 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.65 Å
8QZZ Crystal structure of human eIF2 alpha-gamma complexed with PPP1R15A_420-452 提交 2023-10-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–472(472 aa)
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;11-12% PEG 6000, 0.1M Tris-HCl pH8.5 supplemented with amino acids
分辨率 3.35 Å R-free 0.299
9HVE Native human eIF2-eIF2B complex 提交 2024-12-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 O 1–472(472 aa)
链 P 1–472(472 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9HVF Native human PPP1R15B-P-eIF2-eIF2B complex 提交 2024-12-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–472(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å