当前蛋白身份：P46527
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1H27 CDK2/CyclinA in complex with an 11-residue recruitment peptide from p27 提交 2002-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
25–35（11 aa）
片段：RESIDUES 25-35
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.8M KCL, 1.2M (NH4)2SO4, 40MM HEPES PH 7.0. PROTIEN CONCENTRATION = 10MG/ML
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.269 |
| 1JSU P27(KIP1)/CYCLIN A/CDK2 COMPLEX 提交 1996-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
23–106（84 aa）
片段：RESIDUES 22 - 106
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
181–190（10 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BEN BENZAMIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
181–190（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 2AST Crystal structure of Skp1-Skp2-Cks1 in complex with a p27 peptide 提交 2005-08-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
181–190（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BEN BENZAMIDINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG8K, 5% benzamidine, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 5UQ3 Crystal structure of human Cdk2-Spy1-P27 ternary complex 提交 2017-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–198（198 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；5% PEG 6000, 0.1M MES pH 5.0
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分辨率 3.60 Å R-free 0.324 |
| 6ATH Cdk2/cyclin A/p27-KID-deltaC 提交 2017-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
22–85（64 aa）
片段：UNP residues 22-85
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291.15 K；HEPES, Lithium Sulfate
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分辨率 1.82 Å R-free 0.187 |
| 6P8E Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
25–93（69 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；295 K；100mM Tris (7.0)
200mM MgCl2
25%PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.222 |
| 6P8F Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
25–106（82 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；100mM Tris (7.0)
17% PEG 3350
100 mM CaCl2
10 mM MgCl2
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分辨率 2.89 Å R-free 0.242 |
| 6P8G Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
25–93（69 aa）
|
突变：Y74E, Y88E, Y89E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；295 K；100mM Tris (7.0)
200mM MgCl2
10% PEG 8000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 7B5L Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: NEDD8-CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27-UBE2L3~Ub~ARIH1. Transition State 1 提交 2020-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 P
1–198（198 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 9 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 7B5M Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-p27~Ub~ARIH1. Transition State 2 提交 2020-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 P
1–198（198 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 7B5R Ubiquitin ligation to F-box protein substrates by SCF-RBR E3-E3 super-assembly: CUL1-RBX1-SKP1-SKP2-CKSHS1-Cyclin A-CDK2-p27 提交 2020-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 P
1–198（198 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7OR8 Ternary complex of 14-3-3 sigma, p27pT198 phosphopeptide, and WQ136 提交 2021-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
187–198（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0AW ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-5-carboxamide × 6 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.189 |
| 7ORG Ternary complex of 14-3-3 sigma, p27pT198 phosphopeptide, and WQ162 提交 2021-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
187–198（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 09W ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 7ORH Ternary complex of 14-3-3 sigma, p27pT198 phosphopeptide, and WQ178 提交 2021-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
187–198（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0B7 ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-1~{H}-indole-6-carboxamide × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 7ORS Ternary complex of 14-3-3 sigma, p27pT198 phosphopeptide, and WQ147 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
187–198（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 0I2 (4~{S})-~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]oxepane-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.180 |
| 7ORT Ternary complex of 14-3-3 sigma, p27pT198 phosphopeptide, and WQ176 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
187–198（12 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 0HP ~{N}-[(5-carbamimidoyl-3-phenyl-thiophen-2-yl)methyl]-2-(1~{H}-indol-6-yl)ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 26%PEG 400, 0.19 M CaCl2, and 5 % Glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.228 |
| 8BYL Cryo-EM structure of SKP1-SKP2-CKS1 from the SCFSKP2 E3 ligase complex 提交 2022-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
1–198（198 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |