当前蛋白身份:P46674 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3FWB Sac3:Sus1:Cdc31 complex 提交 2009-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 752–805(54 aa) 片段:residues 752-805
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;0.1M MES pH6.5, 16% PEG4K, 20% glycerol - see publication for complete details, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.235
3FWC Sac3:Sus1:Cdc31 complex 提交 2009-01-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 723–805(83 aa) 片段:residues 723-805
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;unbuffered 16% PEG4K, 20% glycerol, 0.2 M Am sulph. See publication for complete details, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.265
3FWC Sac3:Sus1:Cdc31 complex 提交 2009-01-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 723–805(83 aa) 片段:residues 723-805
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;unbuffered 16% PEG4K, 20% glycerol, 0.2 M Am sulph. See publication for complete details, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.265
3FWC Sac3:Sus1:Cdc31 complex 提交 2009-01-17 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 J 723–805(83 aa) 片段:residues 723-805
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;unbuffered 16% PEG4K, 20% glycerol, 0.2 M Am sulph. See publication for complete details, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.265
3FWC Sac3:Sus1:Cdc31 complex 提交 2009-01-17 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 N 723–805(83 aa) 片段:residues 723-805
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;unbuffered 16% PEG4K, 20% glycerol, 0.2 M Am sulph. See publication for complete details, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.265
3T5V Sac3:Thp1:Sem1 complex 提交 2011-07-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 250–563(314 aa) 片段:M region, UNP 250-563
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;292 K;see publication, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
3T5V Sac3:Thp1:Sem1 complex 提交 2011-07-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 250–563(314 aa) 片段:M region, UNP 250-563
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;292 K;see publication, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.90 Å R-free 0.231
4C31 Nup1:Sac3:Sus1 complex 提交 2013-08-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 757–787(31 aa) 片段:RESIDUES 757-787
链 D 757–787(31 aa) 片段:RESIDUES 757-787
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;DESCRIBED IN DETAIL IN PUBLICATION, pH 6.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.243
4MBE Sac3:Sus1:Cdc31:Nup1 complex 提交 2013-08-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 753–805(53 aa) 片段:CDC31 interacting region, residues 753-805
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.61 Å R-free 0.236
4MBE Sac3:Sus1:Cdc31:Nup1 complex 提交 2013-08-19 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 753–805(53 aa) 片段:CDC31 interacting region, residues 753-805
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;291 K;pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.61 Å R-free 0.236
4TRQ Crystal structure of Sac3/Thp1/Sem1 提交 2014-06-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 253–551(299 aa)
链 D 253–551(299 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;0.5M Li2SO4, 10% PEG-8.000
分辨率 3.10 Å R-free 0.238
5G5P Structure of the Saccharomyces cerevisiae TREX-2 complex 提交 2016-05-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–805(805 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES, 300 MM NACL, 5 MM DTT;pH 8;20 mM HEPES, 300 mM NaCl, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 85 K;冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
分辨率 5.30 Å
5L3T Structure of the Saccharomyces cerevisiae TREX-2 complex 提交 2016-05-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–1301(1301 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Precipitant: 20% PEG 3350, 0.2 M Mg formate; protein 16.5 mg/ml in 0.3 M NaCl, 50 mM HEPES, pH 8, 5 mM DTT.
分辨率 4.93 Å R-free 0.370
8U8C Crystal structure of the TREX-2 complex in complex with the N-terminal motif of Sub2 提交 2023-09-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 60–551(492 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, and 20% PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.231