当前蛋白身份：P53990
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差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3FRR Structure of human IST1(NTD) - (residues 1-189)(P21) 提交 2009-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
片段：UNP residues 1-189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；296 K；35% pentaethritol propexylate
180mM KCl
50 mM HEPES, pH 7.6
7% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 3FRS Structure of human IST1(NTD) (residues 1-189)(p43212) 提交 2009-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5–189（185 aa）
片段：UNP residues 1-189
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；10mM Tris-HCL, pH 8.0,
350mM NaCl, 1mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.298 |
| 3JC1 Electron cryo-microscopy of the IST1-CHMP1B ESCRT-III copolymer 提交 2015-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：68-meric（68） 与蛋白数一致 |
链 Aa
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ac
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ae
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ag
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ai
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ak
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Am
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ao
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Aq
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 As
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Au
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Aw
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ay
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ba
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bc
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Be
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bg
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bi
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bk
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bm
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bo
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bq
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bs
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bu
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Bw
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 By
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ca
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Cc
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ce
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Cg
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ci
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Ck
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Cm
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
链 Co
6–187（182 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 6-187)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM Tris, pH 8.0, 25 mM sodium chloride；pH 8；25 mM Tris, pH 8.0, 25 mM sodium chloride
cryo-EM玻璃化条件
Deposited 3.5 uL sample, blotted 3-6 seconds (0 mm offset)；冷冻剂 ETHANE；Deposited 3.5 uL sample, blotted 3-6 seconds (0 mm offset), and plunged into liquid ethane (VITROBOT MARK III).
|
分辨率 4.00 Å |
| 4U7E The crystal structure of the complex of LIP5 NTD and IST1 MIM 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
341–364（24 aa）
片段：UNP residues 341-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；30% (w/v) PEG5000MME, 0.1 M ammonium sulfate , 0.1 M MES
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 4U7I Structure of the complex of Spartin MIT and IST1 MIM 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
341–364（24 aa）
片段：UNP residues 341-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；2.9 M Na-malonate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.220 |
| 4U7Y Structure of the complex of VPS4B MIT and IST1 MIM 提交 2014-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
341–364（24 aa）
片段：UNP residues 341-364
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；299 K；2.58 M Na-malonate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.271 |
| 4WZX ULK3 regulates cytokinetic abscission by phosphorylating ESCRT-III proteins 提交 2014-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
342–364（23 aa）
片段：MIT-interacting motif (UNP residues 342-364)
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；50mM MES pH 6.5, 5mM Cobalt chloride, 800mM ammonium sulfate
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.180 |
| 6E8G CryoEM reconstruction of IST1-CHMP1B copolymer filament bound to ssDNA at 2.9 Angstrom resolution 提交 2018-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 A
1–366（366 aa）
链 BA
1–366（366 aa）
链 BB
1–366（366 aa）
链 C
1–366（366 aa）
链 DA
1–366（366 aa）
链 DB
1–366（366 aa）
链 E
1–366（366 aa）
链 FA
1–366（366 aa）
链 FB
1–366（366 aa）
链 G
1–366（366 aa）
链 HA
1–366（366 aa）
链 HB
1–366（366 aa）
链 I
1–366（366 aa）
链 JA
1–366（366 aa）
链 JB
1–366（366 aa）
链 K
1–366（366 aa）
链 LA
1–366（366 aa）
链 LB
1–366（366 aa）
链 M
1–366（366 aa）
链 NA
1–366（366 aa）
链 NB
1–366（366 aa）
链 O
1–366（366 aa）
链 PA
1–366（366 aa）
链 PB
1–366（366 aa）
链 Q
1–366（366 aa）
链 RA
1–366（366 aa）
链 RB
1–366（366 aa）
链 S
1–366（366 aa）
链 TA
1–366（366 aa）
链 TB
1–366（366 aa）
链 V
1–366（366 aa）
链 VA
1–366（366 aa）
链 X
1–366（366 aa）
链 XA
1–366（366 aa）
链 Z
1–366（366 aa）
链 ZA
1–366（366 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0 mm offset with 10 sec wait time and 2-4 sec blot
|
分辨率 2.90 Å |
| 6TZ4 CryoEM reconstruction of membrane-bound ESCRT-III filament composed of CHMP1B+IST1 (right-handed) 提交 2019-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric（72） 与蛋白数一致 |
链 01
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 AA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 AB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 B
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 CA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 CB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 D
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 EA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 EB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 F
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 GA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 GB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 H
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 IA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 IB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 J
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 KA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 KB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 L
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 MA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 MB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 N
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 OA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 OB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 P
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 QA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 QB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 R
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 SA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 SB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 T
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 UA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 W
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 WA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 Y
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 YA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.20 Å |
| 6TZ5 CryoEM reconstruction of membrane-bound ESCRT-III filament composed of CHMP1B+IST1 (left-handed) 提交 2019-08-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 68 PDB 声明：68-meric（68） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 BA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 BB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 C
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 DA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 DB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 E
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 FA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 FB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 G
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 HA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 HB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 I
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 JA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 JB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 K
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 LA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 LB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 M
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 NA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 NB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 O
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 PA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 PB
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 Q
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 RA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 S
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 TA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 V
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 VA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 X
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 XA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 Z
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 ZA
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.10 Å |
| 6TZA CryoEM reconstruction of ESCRT-III filament composed of IST1 NTD R16E K27E double mutant 提交 2019-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 B
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 C
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 D
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 E
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 F
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 G
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 H
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 I
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 J
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 K
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 L
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 M
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
链 N
1–189（189 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-189)
|
突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E 突变：R16E K27E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted with Whatman No. 1 filter paper for 4-8 seconds with a 0 mm offset at 19C and 100 percent humidity before plunging into liquid ethane.
|
分辨率 7.20 Å |
| 7S7J Structure of Human SPASTIN-IST1 complex. 提交 2021-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
342–364（23 aa）
片段：UNP residues 342-364
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；40% v/v PEG 300, 100 mM Sodium cacodylate / Hydrochloric acid pH=6.5, 200 mM Calcium Acetate
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 8UC6 Calpain-7:IST1 Complex 提交 2023-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
335–379（45 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；Both proteins were purified and concentrated to 20 mg/ml in buffer containing 25 mM Tris, pH 7.2, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP, 0.5 mM EDTA. The proteins were mixed in a 1:2 molar ratio (CAPN7:IST1). Crystals grew at 21 C (294 K) in Rigaku Wizard Cryo condition D5 (25% (v/v) 1,2-Porpanediol, 100 mM Sodium phosphate dibasic/Citric acid pH 4.2, 5% (w/v) PEG 3000, 10% (v/v) Glycerol. Crystals were transferred briefly to crystallization buffer supplemented with 25% added glycerol prior to plunging in liquid nitrogen
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分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 8UC6 Calpain-7:IST1 Complex 提交 2023-09-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
335–379（45 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；294 K；Both proteins were purified and concentrated to 20 mg/ml in buffer containing 25 mM Tris, pH 7.2, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP, 0.5 mM EDTA. The proteins were mixed in a 1:2 molar ratio (CAPN7:IST1). Crystals grew at 21 C (294 K) in Rigaku Wizard Cryo condition D5 (25% (v/v) 1,2-Porpanediol, 100 mM Sodium phosphate dibasic/Citric acid pH 4.2, 5% (w/v) PEG 3000, 10% (v/v) Glycerol. Crystals were transferred briefly to crystallization buffer supplemented with 25% added glycerol prior to plunging in liquid nitrogen
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分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 8V2Q CHMP1B/IST1 ssRNA bound copolymer 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 182 PDB 声明：182-meric（182） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.95 Å |
| 8V2R CryoEM of ssDNA bound CHMP1B/IST1 copolymer assembly 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 192 PDB 声明：192-meric（192） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.01 Å |
| 8V2S CHMP1B/IST1 dsDNA bound copolymer 提交 2023-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 192 PDB 声明：192-meric（192） 与蛋白数一致 |
链 B
1–364（364 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.72 Å |