当前蛋白身份：P54049
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JSY N-terminal fragment of ribosomal protein L10 from Methanococcus jannaschii 提交 2009-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–221（212 aa）
片段：N-terminal fragment, residues in UNP 10-221
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；KSCN, PEG4000, NaAcetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.233 |
| 3JSY N-terminal fragment of ribosomal protein L10 from Methanococcus jannaschii 提交 2009-09-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–221（212 aa）
片段：N-terminal fragment, residues in UNP 10-221
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；KSCN, PEG4000, NaAcetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.233 |
| 5D6G CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT OF RIBOSOMAL PROTEIN P0 IN COMPLEX WITH 74NT 23S RNA FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-08-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
10–221（212 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；50 mM Sodium Cacodylate, pH 6.5, 0.2 M KCl, 0.1 M Magnesium acetate, 9% PEG 6000, 0.5 mM CTAB
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分辨率 3.30 Å R-free 0.298 |
| 5D8H CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII WITH ANTIBIOTIC THIOSTREPTON 提交 2015-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
9–221（213 aa）
片段：UNP residues 9-221
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突变：Met changed to SeMet 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 11 NA SODIUM ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10% PEG 8000, 20% glycerol, 1 mM TCEP (tris(2-carboxyethyl)phosphine), 0.125 mM CTAB
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分辨率 2.80 Å R-free 0.245 |
| 5DAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-08-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
9–221（213 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 K POTASSIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 0.15 M KCl, 20 mM MgCl2, 15% PEG 4000
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分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 5DAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE BASE OF THE RIBOSOMAL P STALK FROM METHANOCOCCUS JANNASCHII 提交 2015-08-20 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 E
9–221（213 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 0.15 M KCl, 20 mM MgCl2, 15% PEG 4000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |