当前蛋白身份：P55957
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZY3 Structural model of complex of Bcl-w protein with Bid BH3-peptide 提交 2005-06-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
82–101（20 aa）
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突变：R203K | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.7 mM Bcl-w U-15N,13C, 0.7 mM Bid BH3-peptide, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM Bcl-w U-15N, 0.7 mM Bid BH3-peptide, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM Bid BH3-peptide U-15N, 0.7 mM Bcl-w, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2BID HUMAN PRO-APOPTOTIC PROTEIN BID 提交 1999-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 1
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分辨率未提供 |
| 2KBW Solution Structure of human Mcl-1 complexed with human Bid_BH3 peptide 提交 2008-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
76–106（31 aa）
片段：BH3 motif, residues 76-106
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 15N] Mcl-1-1, 0.5 mM Bid_BH3-2, 20 mM HEPES-3, 1 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-5, 0.5 mM [U-95% 15N] Bid_BH3-6, 20 mM HEPES-7, 1 mM DTT-8, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Mcl-1-9, 0.5 mM Bid_BH3-10, 20 mM HEPES-11, 1 mM DTT-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Mcl-1-13, 0.5 mM Bid_BH3-14, 20 mM HEPES-15, 1 mM DTT-16, 100 % [U-100% 2H] D2O-17, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-18, 0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Bid_BH3-19, 20 mM HEPES-20, 1 mM DTT-21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Mcl-1-22, 0.5 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] Bid_BH3-23, 20 mM HEPES-24, 1 mM DTT-25, 100 % [U-100% 2H] D2O-26, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-95% 15N] Mcl-1-27, 0.4 mM Bid_BH3-28, 20 mM HEPES-29, 1 mM DTT-30, 6 mg/mL Pf1 phage-31, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4 mM Mcl-1-32, 0.4 mM [U-95% 15N] Bid_BH3-33, 20 mM HEPES-34, 1 mM DTT-35, 8 mg/mL Pf1 phage-36, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2M5I NMR structures of human apoptotic protein tBid in LPPG micelle 提交 2013-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
61–195（135 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.6；318 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-15N] tBid in LPPG micelle, 0.8 mM [U-13C; U-15N] tBid in LPPG micelle, 0.8 mM [U-100% 15N; U-80% 2H] tBid in LPPG micelle, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] tBid in LPPG micelle, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4BD2 Bax domain swapped dimer in complex with BidBH3 提交 2012-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
76–109（34 aa）
片段：RESIDUES 76-109
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75
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分辨率 2.21 Å R-free 0.227 |
| 4QVE Crystal structure of Bcl-xL in complex with BID BH3 domain 提交 2014-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
76–109（34 aa）
片段：BID BH3, UNP RESIDUES 76-109
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未记录 | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；291 K；2.0M Ammonium Sulphate, 0.2M Lithium Sulphate, 0.1M CAPS pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.224 |
| 4ZEQ Crystal Structure of human BFL-1 in complex with tBid BH3 peptide, Northeast Structural Genomics Consortium Target HX9247 提交 2015-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
125–150（26 aa）
片段：UNP Residues 125-150
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；295 K；Sodium Malonate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 4ZIG Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BidBH3mini 提交 2015-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
125–144（20 aa）
片段：BH3 motif
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 4ZII Crystal Structure of core/latch dimer of BaxI66A in complex with BidBH3 提交 2015-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
122–155（34 aa）
片段：BH3 motif
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, sodium cacodylate
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.223 |
| 5AJJ Crystal structure of variola virus virulence factor F1L in complex with human Bid BH3 domain 提交 2015-02-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
79–112（34 aa）
片段：UNP RESIDUES 79-112
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.8 M SODIUM ACETATE AND 0.1 M HEPES PH 6.5
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分辨率 1.75 Å R-free 0.208 |
| 7M5A Crystal Structure of human BAK in complex with W3W5_BID 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
80–100（21 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.2 M Potassium Sodium tartrate, 20% PEG 3350
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分辨率 1.50 Å R-free 0.219 |
| 7M5B Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
80–100（21 aa）
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未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；293 K；15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 7M5B Crystal Structure of human BAK in complex with M3W5_BID 提交 2021-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
80–100（21 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；293 K；15% PEG 4000 0.2 M NaCl 0.1 MES 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 7P33 Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide 提交 2021-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
76–109（34 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.274 |
| 7P33 Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide 提交 2021-07-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
76–109（34 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.274 |
| 7P33 Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide 提交 2021-07-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
76–109（34 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.274 |
| 7P33 Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide 提交 2021-07-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
76–109（34 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.274 |
| 7P33 Epstein-Barr virus encoded Bcl-2 homolog BHRF-1 in complex with Bid BH3 peptide 提交 2021-07-07 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
76–109（34 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4M Ammonium phosphate mono basic
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.274 |
| 7QTW Kaposi sarcoma associated herpes virus(KSHV) encoded apoptosis inhibitor, KsBcl-2 in complex with Bid BH3 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
76–109（34 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6
8% PEG 4000
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.215 |