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Protein Structures and Oligomeric States

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Current Protein Identity：P56546 New Search
3PDB entries
3Biological assembly
82chain/assembly records
Main Difference Dimensions in This Set
Different construct Different assembly state Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry Assembly / Oligomeric State Construct Mutations and Modifications Ligands, Ions and Non-polymers Experimental Method Experimental Conditions Structure Quality
9WBJ cryo-EM structure of RIBEYE SAM thick filament Deposited 2025-08-14 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 34 PDB declaration: 34-meric（34） Consistent with protein count
Chain A 280–375（96 aa）
Chain B 280–375（96 aa）
Chain C 280–375（96 aa）
Chain D 280–375（96 aa）
Chain E 280–375（96 aa）
Chain F 280–375（96 aa）
Chain G 280–375（96 aa）
Chain H 280–375（96 aa）
Chain I 280–375（96 aa）
Chain J 280–375（96 aa）
Chain K 280–375（96 aa）
Chain L 280–375（96 aa）
Chain M 280–375（96 aa）
Chain N 280–375（96 aa）
Chain O 280–375（96 aa）
Chain P 280–375（96 aa）
Chain Q 280–375（96 aa）
Chain R 280–375（96 aa）
Chain S 280–375（96 aa）
Chain T 280–375（96 aa）
Chain U 280–375（96 aa）
Chain V 280–375（96 aa）
Chain W 280–375（96 aa）
Chain X 280–375（96 aa）
Chain Y 280–375（96 aa）
Chain Z 280–375（96 aa）
Chain a 280–375（96 aa）
Chain b 280–375（96 aa）
Chain c 280–375（96 aa）
Chain d 280–375（96 aa）
Chain e 280–375（96 aa）
Chain f 280–375（96 aa）
Chain g 280–375（96 aa）
Chain h 280–375（96 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY mmCIF provides none of the parsed conditions Resolution 3.37 Å
9WBK cryo-EM structure of RIBEYE SAM thin filament Deposited 2025-08-14 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 28 PDB declaration: 28-meric（28） Consistent with protein count
Chain B 280–375（96 aa）
Chain C 280–375（96 aa）
Chain D 280–375（96 aa）
Chain E 280–375（96 aa）
Chain F 280–375（96 aa）
Chain G 280–375（96 aa）
Chain H 280–375（96 aa）
Chain I 280–375（96 aa）
Chain J 280–375（96 aa）
Chain K 280–375（96 aa）
Chain L 280–375（96 aa）
Chain M 280–375（96 aa）
Chain N 280–375（96 aa）
Chain O 280–375（96 aa）
Chain P 280–375（96 aa）
Chain Q 280–375（96 aa）
Chain R 280–375（96 aa）
Chain S 280–375（96 aa）
Chain T 280–375（96 aa）
Chain U 280–375（96 aa）
Chain V 280–375（96 aa）
Chain W 280–375（96 aa）
Chain X 280–375（96 aa）
Chain Y 280–375（96 aa）
Chain Z 280–375（96 aa）
Chain a 280–375（96 aa）
Chain b 280–375（96 aa）
Chain c 280–375（96 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY mmCIF provides none of the parsed conditions Resolution 3.39 Å
9WBL cryo-EM structure of RIBEYE B' filament Deposited 2025-08-14 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 20 PDB declaration: eicosameric（20） Consistent with protein count
Chain A 545–988（444 aa）
Chain B 545–988（444 aa）
Chain C 545–988（444 aa）
Chain D 545–988（444 aa）
Chain E 545–988（444 aa）
Chain F 545–988（444 aa）
Chain G 545–988（444 aa）
Chain H 545–988（444 aa）
Chain I 545–988（444 aa）
Chain J 545–988（444 aa）
Chain K 545–988（444 aa）
Chain L 545–988（444 aa）
Chain M 545–988（444 aa）
Chain N 545–988（444 aa）
Chain O 545–988（444 aa）
Chain P 545–988（444 aa）
Chain Q 545–988（444 aa）
Chain R 545–988（444 aa）
Chain S 545–988（444 aa）
Chain T 545–988（444 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY mmCIF provides none of the parsed conditions Resolution 3.41 Å

This page presents structural evidence recorded in PDB/mmCIF.“No recorded non-water small molecule” does not prove that the experimental sample was ligand-free; experimental conditions belong to the PDB experiment, while ligands and copy counts are shown for each biological assembly.