当前蛋白身份：P69592
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：240-MERIC（240） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 360 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
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未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 30 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
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未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 36 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 6 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：80-meric（80） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–37（37 aa）
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未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 120 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 2BPA ATOMIC STRUCTURE OF SINGLE-STRANDED DNA BACTERIOPHAGE PHIX174 AND ITS FUNCTIONAL IMPLICATIONS 提交 1991-12-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：240-MERIC（240） 与全部聚合物一致 |
链 3
2–38（37 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 2BPA ATOMIC STRUCTURE OF SINGLE-STRANDED DNA BACTERIOPHAGE PHIX174 AND ITS FUNCTIONAL IMPLICATIONS 提交 1991-12-03 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 3
2–38（37 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 2BPA ATOMIC STRUCTURE OF SINGLE-STRANDED DNA BACTERIOPHAGE PHIX174 AND ITS FUNCTIONAL IMPLICATIONS 提交 1991-12-03 | Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 3
2–38（37 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 2BPA ATOMIC STRUCTURE OF SINGLE-STRANDED DNA BACTERIOPHAGE PHIX174 AND ITS FUNCTIONAL IMPLICATIONS 提交 1991-12-03 | Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 3
2–38（37 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 2BPA ATOMIC STRUCTURE OF SINGLE-STRANDED DNA BACTERIOPHAGE PHIX174 AND ITS FUNCTIONAL IMPLICATIONS 提交 1991-12-03 | Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 3
2–38（37 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 9K3M The structure of Microviridae PJNS001 提交 2024-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 AC
1–38（38 aa）
链 AF
1–38（38 aa）
链 BA
1–38（38 aa）
链 BD
1–38（38 aa）
链 C
1–38（38 aa）
链 CB
1–38（38 aa）
链 CE
1–38（38 aa）
链 DC
1–38（38 aa）
链 DF
1–38（38 aa）
链 EA
1–38（38 aa）
链 ED
1–38（38 aa）
链 FB
1–38（38 aa）
链 FE
1–38（38 aa）
链 GC
1–38（38 aa）
链 GF
1–38（38 aa）
链 H
1–38（38 aa）
链 HA
1–38（38 aa）
链 HD
1–38（38 aa）
链 IB
1–38（38 aa）
链 IE
1–38（38 aa）
链 J
1–38（38 aa）
链 JC
1–38（38 aa）
链 JF
1–38（38 aa）
链 KA
1–38（38 aa）
链 KD
1–38（38 aa）
链 L
1–38（38 aa）
链 LB
1–38（38 aa）
链 LE
1–38（38 aa）
链 MC
1–38（38 aa）
链 MF
1–38（38 aa）
链 NA
1–38（38 aa）
链 ND
1–38（38 aa）
链 O
1–38（38 aa）
链 OB
1–38（38 aa）
链 OE
1–38（38 aa）
链 PC
1–38（38 aa）
链 PF
1–38（38 aa）
链 QA
1–38（38 aa）
链 QD
1–38（38 aa）
链 R
1–38（38 aa）
链 RB
1–38（38 aa）
链 RE
1–38（38 aa）
链 SC
1–38（38 aa）
链 SF
1–38（38 aa）
链 TA
1–38（38 aa）
链 TD
1–38（38 aa）
链 UB
1–38（38 aa）
链 UE
1–38（38 aa）
链 V
1–38（38 aa）
链 VC
1–38（38 aa）
链 VF
1–38（38 aa）
链 WA
1–38（38 aa）
链 WD
1–38（38 aa）
链 XB
1–38（38 aa）
链 XE
1–38（38 aa）
链 Y
1–38（38 aa）
链 YC
1–38（38 aa）
链 YF
1–38（38 aa）
链 ZA
1–38（38 aa）
链 ZD
1–38（38 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；pH 7.2~7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.68 Å |