当前蛋白身份:Q00604
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4MY2 Crystal Structure of Norrin in fusion with Maltose Binding Protein 提交 2013-09-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–104(104 aa)
片段:Maltose binding protein (UNP residues 26-392), Norrin (UNP residues 30-133) fusion protein
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;298 K;15% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 5BPU Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form I 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 B
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 5% PGA-LM, 30% PEG550MME
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 5BPU Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form I 提交 2015-05-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 D
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 5% PGA-LM, 30% PEG550MME
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 5BPU Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form I 提交 2015-05-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 F
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 5% PGA-LM, 30% PEG550MME
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.263 |
| 5BQ8 Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
片段:UNP residues 25-133
链 B
25–133(109 aa)
片段:UNP residues 25-133
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 sodium acetate, pH 5.0, 5% PGA-LM, 4% PEG2000MME, 24% PEG550MME
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分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 5BQ8 Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form II 提交 2015-05-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
25–133(109 aa)
片段:UNP residues 25-133
链 D
25–133(109 aa)
片段:UNP residues 25-133
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 sodium acetate, pH 5.0, 5% PGA-LM, 4% PEG2000MME, 24% PEG550MME
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 5BQB Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form III 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 B
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
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未记录 | CIT CITRIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1M citrate, pH 5.0, 30% PEG6000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.251 |
| 5BQB Crystal structure of Norrin, a Wnt signalling activator, Crystal Form III 提交 2015-05-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 D
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1M citrate, pH 5.0, 30% PEG6000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.251 |
| 5BQC Crystal structure of Norrin in complex with the cysteine-rich domain of Frizzled 4 and sucrose octasulfate 提交 2015-05-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M Tris, pH 8.0, 0.15 M NaCl, 8% PEG8000
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分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 5BQE Crystal structure of Norrin in complex with the cysteine-rich domain of Frizzled 4 -Methylated form 提交 2015-05-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
链 B
25–133(109 aa)
片段:residues 25-133
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;0.1 M Bicine, pH 9.0, 10% PEG6000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 5CL1 Complex structure of Norrin with human Frizzled 4 提交 2015-07-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
31–133(103 aa)
片段:UNP Q00604 residues 31-133
链 B
31–133(103 aa)
片段:UNP Q00604 residues 31-133
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;200 mM ammonium sulfate, 100 mM sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), 15% w/v polyethylene glycol 8,000
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分辨率 3.80 Å R-free 0.310 |
| 8WVX Cryo-EM structure of LGR4 in complex with Norrin(dimer) 提交 2023-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
31–133(103 aa)
链 D
31–133(103 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 PROPANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 8WVY Cryo-EM structure of LGR4 in complex with Norrin 提交 2023-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
31–133(103 aa)
链 F
31–133(103 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 PROPANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9KHH Structure of the complex of LGR4 with Norrin (2:2) 提交 2024-11-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 E
25–133(109 aa)
链 F
25–133(109 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.65 Å |
| 9MAN Structure of Norrin in complex with human Tspan12 large extracellular loop (Tspan12 LEL) 提交 2025-03-14 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
25–133(109 aa)
链 B
25–133(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 9UOK Structure of the complex of LGR4_ECD with Norrin 提交 2025-04-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 E
25–133(109 aa)
链 F
25–133(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |