当前蛋白身份：Q01484
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4D8O Crystal Structure of the ankyrin-B ZU5-ZU5-UPA-DD tandem 提交 2012-01-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
966–1210（245 aa）
片段：residues 966-1535
链 A
1253–1568（316 aa）
片段：residues 966-1535
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；18% PEG3350, 0.2M ammonium acetate, 5% n-Octyl-beta-D-glucoside, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.245 |
| 4RLV Crystal Structure of AnkB 24 Ankyrin Repeats in Complex with AnkR Autoinhibition Segment 提交 2014-10-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–873（846 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.5 M ammonium sulfate, 1.0 M lithium sulfate, and 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.253 |
| 4RLY Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats (R1-R9) in Complex with Nav1.2 Ankyrin Binding Domain 提交 2014-10-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–318（291 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；1.8 M ammonium sulfate, 6-8% dioxane, and 0.1 M MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 4RLY Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats (R1-R9) in Complex with Nav1.2 Ankyrin Binding Domain 提交 2014-10-18 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–318（291 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；1.8 M ammonium sulfate, 6-8% dioxane, and 0.1 M MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 5Y4D Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats in Complex with AnkR/AnkB Chimeric Autoinhibition Segment 提交 2017-08-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3707–3718（12 aa）
片段：UNP RESIDUES 1577-1613,UNP RESIDUES 3707-3718,UNP RESIDUES 28-693
链 A
28–693（666 aa）
片段：UNP RESIDUES 1577-1613,UNP RESIDUES 3707-3718,UNP RESIDUES 28-693
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；4 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 7.0)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.229 |
| 5Y4E Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats R8-14 in complex with autoinhibition segment AI-b 提交 2017-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
857–896（40 aa）
片段：UNP RESIDUES 857-896,UNP RESIDUES 264-483
链 A
264–483（220 aa）
片段：UNP RESIDUES 857-896,UNP RESIDUES 264-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 1 M ammonium sulfate, 0.5% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.233 |
| 5Y4E Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats R8-14 in complex with autoinhibition segment AI-b 提交 2017-08-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
857–896（40 aa）
片段：UNP RESIDUES 857-896,UNP RESIDUES 264-483
链 B
264–483（220 aa）
片段：UNP RESIDUES 857-896,UNP RESIDUES 264-483
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 1 M ammonium sulfate, 0.5% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.233 |
| 5Y4F Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats R13-24 in complex with autoinhibition segment AI-c 提交 2017-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
430–873（444 aa）
片段：UNP RESIDUES 430-873
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES (pH 7.5), 28% v/v PEG 400
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 5Y4F Crystal Structure of AnkB Ankyrin Repeats R13-24 in complex with autoinhibition segment AI-c 提交 2017-08-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
430–873（444 aa）
片段：UNP RESIDUES 430-873
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M HEPES (pH 7.5), 28% v/v PEG 400
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1588–1614（27 aa）
片段：UNP RESIDUES 1588-1614
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1588–1614（27 aa）
片段：UNP RESIDUES 1588-1614
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1588–1614（27 aa）
片段：UNP RESIDUES 1588-1614
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 5YIS Crystal Structure of AnkB LIR/LC3B complex 提交 2017-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1588–1614（27 aa）
片段：UNP RESIDUES 1588-1614
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；289 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1 M Tris buffer (pH 8.5)
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 5YIS Crystal Structure of AnkB LIR/LC3B complex 提交 2017-10-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1588–1614（27 aa）
片段：UNP RESIDUES 1588-1614
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；289 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1 M Tris buffer (pH 8.5)
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 6KZJ Crystal structure of Ankyrin B/NdeL1 complex 提交 2019-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1499–1570（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；289 K；1.9M ammonium sulfate,
0.16M potassium sodium tartrate tetrahydrate,
0.1M sodium citrate tribasic dehydrate pH 5.6
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.211 |
| 6M3Q Crystal structure of AnkB/beta4-spectrin complex 提交 2020-03-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
951–1458（508 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；25% w/v pentaerythritol propoxylate 629 (17/8 PO/OH), 50 mM magnesium chloride and 0.1 M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 3.44 Å R-free 0.307 |
| 8ZE8 Arf-GTPase activating protein Asap1 SH3 domain in complex with 440 Kd Ankyrin-B fragment 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1699–1710（12 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M MES monohydrate, pH=6.0, 20 % w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.226 |
| 8ZE8 Arf-GTPase activating protein Asap1 SH3 domain in complex with 440 Kd Ankyrin-B fragment 提交 2024-05-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1699–1710（12 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M MES monohydrate, pH=6.0, 20 % w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.226 |
| 8ZE8 Arf-GTPase activating protein Asap1 SH3 domain in complex with 440 Kd Ankyrin-B fragment 提交 2024-05-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1699–1710（12 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M MES monohydrate, pH=6.0, 20 % w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.226 |
| 8ZE8 Arf-GTPase activating protein Asap1 SH3 domain in complex with 440 Kd Ankyrin-B fragment 提交 2024-05-04 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1699–1710（12 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M MES monohydrate, pH=6.0, 20 % w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.226 |