当前蛋白身份:Q01831 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 I 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:13-meric(13) 与全部聚合物一致
链 I 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:13-meric(13) 与全部聚合物一致
链 I 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致
链 I 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
2GGM Human centrin 2 xeroderma pigmentosum group C protein complex 提交 2006-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 847–863(17 aa) 片段:Centrin Binding Region (residues 846-862)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;2.5-3.2 M (NH4)2SO4, 0.1-0.4 M Na2HPO4, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.245
2GGM Human centrin 2 xeroderma pigmentosum group C protein complex 提交 2006-03-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 847–863(17 aa) 片段:Centrin Binding Region (residues 846-862)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;2.5-3.2 M (NH4)2SO4, 0.1-0.4 M Na2HPO4, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.245
2OBH Centrin-XPC peptide 提交 2006-12-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 846–862(17 aa) 片段:XPC fragment (Residues: 847-863)
链 D 846–862(17 aa) 片段:XPC fragment (Residues: 847-863)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;298 K;30% MPEG 550, 0.1M NaCl, 0.1M Bicine pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.265
2RVB Solution structure of the complex between XPC acidic domain and TFIIH p62 PH domain 提交 2015-07-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 109–156(48 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;305 K;离子强度(mmCIF原始值)0.02;压力 ambient
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] XPC acidic domain-1, 0.48 mM TFIIH p62 PH domain-2, 20 mM potassium phosphate-3, 5 mM [U-2H] DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] XPC acidic domain-5, 0.48 mM TFIIH p62 PH domain-6, 20 mM potassium phosphate-7, 5 mM [U-2H] DTT-8, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-9, 0.48 mM XPC acidic domain-10, 20 mM potassium phosphate-11, 5 mM [U-2H] DTT-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-13, 0.48 mM XPC acidic domain-14, 20 mM potassium phosphate-15, 5 mM [U-2H] DTT-16, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:15-meric(15) 与全部聚合物一致
链 H 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:17-meric(17) 与全部聚合物一致
链 H 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 H 1–940(940 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å