9pcp

NER dual incision complex - NoG

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 217.3 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9pcp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9pcp
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9pcp
沉积日期 deposition_date2025-06-28
结构标题 titleNER dual incision complex - NoG
关键词 keywordsNER, XPA, XPG, XPF, DNA binding protein, DNA binding protein-DNA complex; DNA binding protein/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier67.45
回转半径 Rg (电子) rg_electron67.36
零角强度 I(0) i03964400000.00
分子量 molecular_weight518910.0 kDa
排除体积 excluded_volume644140 ų
包络体积 envelope_volume1042100 ų
水化壳体积 shell_volume132120 ų
包络直径 envelope_diameter246.9
壳层 Rg shell_rg66.21
包络 Rg envelope_rg65.63
形状 Rg shape_rg67.37
总 Rg total_rg67.29
总原子数 total_atoms36347
残基数 n_residues4416
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax217.3
Rg (实空间) rg_real67.55
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.62
I(0) (实空间) i0_real3.9630e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.2980e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal66.89
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3959000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8435
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary75.6
偏度 Skewness skewness0.462
峰度 Kurtosis kurtosis-0.203
角度范围 angular_range— – 0.1150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0009
最高正则化参数 α highest_alpha268700000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.916; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.213

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (18)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)