当前蛋白身份:Q02080
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1N6J Structural basis of sequence-specific recruitment of histone deacetylases by Myocyte Enhancer Factor-2 提交 2002-11-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
2–94(93 aa)
片段:residues 2-91, MADS-box/MEF2S domain
链 B
2–94(93 aa)
片段:residues 2-91, MADS-box/MEF2S domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;PEG 3500, sodium cholride, BTP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 1TQE Mechanism of recruitment of class II histone deacetylases by myocyte enhancer factor-2 提交 2004-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 P
1–93(93 aa)
片段:residues 1-93
链 Q
1–93(93 aa)
片段:residues 1-93
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.35;315 K;BTP, PEG, NaCl, glycerol, MgCl2, CaCl2, pH 6.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 1TQE Mechanism of recruitment of class II histone deacetylases by myocyte enhancer factor-2 提交 2004-06-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 R
1–93(93 aa)
片段:residues 1-93
链 S
1–93(93 aa)
片段:residues 1-93
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.35;315 K;BTP, PEG, NaCl, glycerol, MgCl2, CaCl2, pH 6.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
65–91(27 aa)
链 B
65–91(27 aa)
|
未记录 | 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.266 |
| 6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 C
65–91(27 aa)
链 D
65–91(27 aa)
|
未记录 | TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.266 |
| 6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 C
65–91(27 aa)
链 D
65–91(27 aa)
|
突变:D83V 突变:D83V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.190 |
| 6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
65–91(27 aa)
链 B
65–91(27 aa)
|
突变:D83V 突变:D83V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.190 |
| 6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–93(93 aa)
链 B
1–93(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.235 |
| 6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
1–93(93 aa)
链 D
1–93(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.235 |
| 6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
1–93(93 aa)
链 F
1–93(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.235 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
73–91(19 aa)
链 B
73–91(19 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 C
73–91(19 aa)
链 D
73–91(19 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 3 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 I
73–91(19 aa)
链 J
73–91(19 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.225 |
| 6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
2–91(90 aa)
链 B
2–91(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.251 |
| 6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 C
2–91(90 aa)
链 D
2–91(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.251 |