当前蛋白身份:Q02080 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1N6J Structural basis of sequence-specific recruitment of histone deacetylases by Myocyte Enhancer Factor-2 提交 2002-11-11 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 2–94(93 aa) 片段:residues 2-91, MADS-box/MEF2S domain
链 B 2–94(93 aa) 片段:residues 2-91, MADS-box/MEF2S domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;298 K;PEG 3500, sodium cholride, BTP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1TQE Mechanism of recruitment of class II histone deacetylases by myocyte enhancer factor-2 提交 2004-06-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 P 1–93(93 aa) 片段:residues 1-93
链 Q 1–93(93 aa) 片段:residues 1-93
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.35;315 K;BTP, PEG, NaCl, glycerol, MgCl2, CaCl2, pH 6.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1TQE Mechanism of recruitment of class II histone deacetylases by myocyte enhancer factor-2 提交 2004-06-17 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 R 1–93(93 aa) 片段:residues 1-93
链 S 1–93(93 aa) 片段:residues 1-93
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.35;315 K;BTP, PEG, NaCl, glycerol, MgCl2, CaCl2, pH 6.35, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 65–91(27 aa)
链 B 65–91(27 aa)
未记录 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
6BYY MEF2 CHIMERA/DNA Complex 提交 2017-12-21 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 65–91(27 aa)
链 D 65–91(27 aa)
未记录 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M HAc pH 4.7, 150 mM NaCl, 10 mM CaCl2, 5 mM MgCl2 and 28% PEG 400
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 65–91(27 aa)
链 D 65–91(27 aa)
突变:D83V 突变:D83V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.190
6BZ1 MEF2 Chimera D83V mutant/DNA complex 提交 2017-12-21 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 65–91(27 aa)
链 B 65–91(27 aa)
突变:D83V 突变:D83V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;0.1M MES pH 5.94, 0.2 M NaCl and 18% PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.190
6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–93(93 aa)
链 B 1–93(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–93(93 aa)
链 D 1–93(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6C9L MEF2B Apo Protein Structure 提交 2018-01-26 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 1–93(93 aa)
链 F 1–93(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.4 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 73–91(19 aa)
链 B 73–91(19 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 73–91(19 aa)
链 D 73–91(19 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC2 Crystal Structure of a Ternary MEF2 Chimera/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 3 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 I 73–91(19 aa)
链 J 73–91(19 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 2–91(90 aa)
链 B 2–91(90 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
6WC5 Crystal Structure of a Ternary MEF2B/NKX2-5/myocardin enhancer DNA Complex 提交 2020-03-29 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 C 2–91(90 aa)
链 D 2–91(90 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;291 K;100 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 2000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251