当前蛋白身份:Q02206 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2R0S Crystal Structure of the Rsc4 tandem bromodomain 提交 2007-08-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 36–320(285 aa) 片段:Rsc4 tandem bromodomain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;298 K;0.1M phosphate-citrate, 0.2M NaCl, 0.2M ammonium sulfate, 20% PEG 3000, 5% Glycerol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.218
2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–340(340 aa) 片段:Rsc4 TBD (1-340)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–340(340 aa) 片段:Rsc4 TBD (1-340)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–340(340 aa) 片段:Rsc4 TBD (1-340)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2R0Y Structure of the Rsc4 tandem bromodomain in complex with an acetylated H3 peptide 提交 2007-08-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–340(305 aa) 片段:Rsc4 tandem bromodomain (36-340)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;298 K;0.1M phosphate-citrate, 0.2M NaCl, 0.2M ammonium sulfate, 20% PEG 3000, 5% Glycerol, pH 4.2, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.75 Å R-free 0.219
2R10 Structure of an acetylated Rsc4 tandem bromodomain Histone Chimera 提交 2007-08-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–340(340 aa) 片段:fusion protein comprises Histone H3 (6-18) and Rsc4 TBD (22-361)
突变:k9(ALY), K25(ALY) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;298 K;0.1M Tris, 0.2M lithium sulfate, 28% PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.50
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2R10 Structure of an acetylated Rsc4 tandem bromodomain Histone Chimera 提交 2007-08-21 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–340(340 aa) 片段:fusion protein comprises Histone H3 (6-18) and Rsc4 TBD (22-361)
突变:k9(ALY), K25(ALY) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;298 K;0.1M Tris, 0.2M lithium sulfate, 28% PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.50
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
6K15 RSC substrate-recruitment module 提交 2019-05-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 X 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 X 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.13 Å
6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 X 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.55 Å
6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 X 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.13 Å
6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 R 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.00 Å
6V8O RSC core 提交 2019-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 H 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致
链 H 1–625(625 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 20.00 Å