当前蛋白身份:Q02206
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2R0S Crystal Structure of the Rsc4 tandem bromodomain 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
36–320(285 aa)
片段:Rsc4 tandem bromodomain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;298 K;0.1M phosphate-citrate, 0.2M NaCl, 0.2M ammonium sulfate, 20% PEG 3000, 5% Glycerol, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–340(340 aa)
片段:Rsc4 TBD (1-340)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.230 |
| 2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–340(340 aa)
片段:Rsc4 TBD (1-340)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.230 |
| 2R0V Structure of the Rsc4 tandem bromodomain acetylated at K25 提交 2007-08-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
1–340(340 aa)
片段:Rsc4 TBD (1-340)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;298 K;0.1M Tris, 0.2M ammonium sulfate, 22% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.00
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.230 |
| 2R0Y Structure of the Rsc4 tandem bromodomain in complex with an acetylated H3 peptide 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
36–340(305 aa)
片段:Rsc4 tandem bromodomain (36-340)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.2;298 K;0.1M phosphate-citrate, 0.2M NaCl, 0.2M ammonium sulfate, 20% PEG 3000, 5% Glycerol, pH 4.2, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 2R10 Structure of an acetylated Rsc4 tandem bromodomain Histone Chimera 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–340(340 aa)
片段:fusion protein comprises Histone H3 (6-18) and Rsc4 TBD (22-361)
|
突变:k9(ALY), K25(ALY) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5;298 K;0.1M Tris, 0.2M lithium sulfate, 28% PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.50
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 2R10 Structure of an acetylated Rsc4 tandem bromodomain Histone Chimera 提交 2007-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–340(340 aa)
片段:fusion protein comprises Histone H3 (6-18) and Rsc4 TBD (22-361)
|
突变:k9(ALY), K25(ALY) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5;298 K;0.1M Tris, 0.2M lithium sulfate, 28% PEG 3000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K, pH 8.50
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 6K15 RSC substrate-recruitment module 提交 2019-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致 |
链 X
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.13 Å |
| 6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.55 Å |
| 6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致 |
链 X
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.13 Å |
| 6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致 |
链 R
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 15.00 Å |
| 6V8O RSC core 提交 2019-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致 |
链 H
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致 |
链 H
1–625(625 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 20.00 Å |