当前蛋白身份：Q02440
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1OE9 Crystal structure of Myosin V motor with essential light chain-nucleotide-free 提交 2003-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-792
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；6% PEG8000 (W/V), 50MM MOPS PH 6.5, 2MM DTT, 2MM NAN3
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.264 |
| 1W7I Crystal Structure Of Myosin V Motor Without nucleotide soaked in 10 mM MgADP 提交 2004-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-792
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；6% PEG 8000, 50 MM MOPS PH 6.5, 2 MM DTT AND 2 MM NAN3
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.318 |
| 1W7J Crystal Structure Of Myosin V Motor With Essential Light Chain + ADP-BeFx - Near Rigor 提交 2004-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-792
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；12% PEG 8000, 50 MM MES PH 6.3, 2 MM DTT AND 2 MM NAN3
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.224 |
| 1W8J Crystal Structure Of Myosin V Motor Domain - Nucleotide-Free 提交 2004-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–766（766 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-766
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；10% PEG 8000, 50 MM MES PH 6.3, 100 MM AMMONIUM SULPHATE, 2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 1W8J Crystal Structure Of Myosin V Motor Domain - Nucleotide-Free 提交 2004-09-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–766（766 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-766
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；10% PEG 8000, 50 MM MES PH 6.3, 100 MM AMMONIUM SULPHATE, 2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 1W8J Crystal Structure Of Myosin V Motor Domain - Nucleotide-Free 提交 2004-09-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–766（766 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-766
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；10% PEG 8000, 50 MM MES PH 6.3, 100 MM AMMONIUM SULPHATE, 2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 1W8J Crystal Structure Of Myosin V Motor Domain - Nucleotide-Free 提交 2004-09-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–766（766 aa）
片段：MOTOR DOMAIN, RESIDUES 1-766
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；10% PEG 8000, 50 MM MES PH 6.3, 100 MM AMMONIUM SULPHATE, 2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 2DFS 3-D structure of Myosin-V inhibited state 提交 2006-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1080（1080 aa）
片段：residues 1-1080
链 M
1–1080（1080 aa）
片段：residues 1-1080
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
20mM Na2HPO4, 80-100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM ADP, 1mM EGTA, 8-9% PEG 8000；20mM Na2HPO4, 80-100mM NaCl, 2mM MgCl2, 1mM ADP, 1mM EGTA, 8-9% PEG 8000
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；liquid ethane
|
分辨率 24.00 Å |
| 7PLT Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.30 Å |
| 7PLU Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 3er/2er) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
链 D
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.20 Å |
| 7PLV Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, class 1) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PLW Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, class 2) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PLX Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, class 4) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.60 Å |
| 7PLY Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, young JASP-stabilized F-actin) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9UE Jasplakinolide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.20 Å |
| 7PLZ Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 3er/2er, young JASP-stabilized F-actin) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
链 D
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 9UE Jasplakinolide × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.20 Å |
| 7PM0 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, young JASP-stabilized F-actin, class 1) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9UE Jasplakinolide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.60 Å |
| 7PM1 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, young JASP-stabilized F-actin, class 2) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9UE Jasplakinolide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PM2 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the rigor state (central 1er, young JASP-stabilized F-actin, class 4) 提交 2021-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 9UE Jasplakinolide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.60 Å |
| 7PM5 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.10 Å |
| 7PM6 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 3er/2er) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
链 D
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.00 Å |
| 7PM7 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 2) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PM8 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 3) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.50 Å |
| 7PM9 Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 4) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.70 Å |
| 7PMA Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 5) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.60 Å |
| 7PMB Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 6) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.60 Å |
| 7PMC Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the strong-ADP state (central 1er, class 7) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration
|
分辨率 3.70 Å |
| 7PMD Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 2.90 Å |
| 7PME Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 3er/2er) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
链 D
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 2.90 Å |
| 7PMF Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 1) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.40 Å |
| 7PMG Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 3) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.30 Å |
| 7PMH Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 4) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.40 Å |
| 7PMI Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 5) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.30 Å |
| 7PMJ Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 6) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.40 Å |
| 7PML Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er, class 8) 提交 2021-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–792（792 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；On grid decoration, two data sets combined
|
分辨率 3.30 Å |