当前蛋白身份:Q02724 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1EUV X-RAY STRUCTURE OF THE C-TERMINAL ULP1 PROTEASE DOMAIN IN COMPLEX WITH SMT3, THE YEAST ORTHOLOG OF SUMO. 提交 2000-04-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 401–621(221 aa) 片段:C-TERMINAL PROTEASE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M MES pH6.5, 10% w/v polyethylene glycol 20000, 3% w/v 1,6-hexandiol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.60 Å R-free 0.251
2HKP SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfenic acid 提交 2006-07-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 403–621(219 aa) 片段:c-terminal catalytic domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;20% w/v PEG 3350, 0.2M NaCl and post-soaked in 50mM DTT for 48 hours, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
2HL8 SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfinic acid 提交 2006-07-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 403–621(219 aa) 片段:c-terminal catalytic domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;20%(w/v) PEG 3350, 0.2M NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
2HL9 SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfonic acid 提交 2006-07-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 403–621(219 aa) 片段:c-terminal catalytic domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;30%(v/v) pentaerythritol ethoxylate(15/4 EO/OH), 0.05M ammonium sulfate, 100mM hydrogen peroxide , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
5H2V Crystal structure of the karyopherin Kap121p bound to the SUMO protease Ulp1p 提交 2016-10-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–150(150 aa) 片段:UNP residues 1-150
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.1M HEPES, 10% 2-propanol, 24% PEG20000
分辨率 2.80 Å R-free 0.241
5H2W Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-340) 提交 2016-10-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 150–340(191 aa) 片段:UNP residues 150-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M MES, 0.1M calcium acetate, 12% PEG8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
5H2W Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-340) 提交 2016-10-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 150–340(191 aa) 片段:UNP residues 150-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M MES, 0.1M calcium acetate, 12% PEG8000
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
5H2X Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-172) 提交 2016-10-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 150–172(23 aa) 片段:UNP residues 150-172
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium phosphate, 12% PEG8000
分辨率 2.20 Å R-free 0.228