当前蛋白身份:Q02724
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EUV X-RAY STRUCTURE OF THE C-TERMINAL ULP1 PROTEASE DOMAIN IN COMPLEX WITH SMT3, THE YEAST ORTHOLOG OF SUMO. 提交 2000-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
401–621(221 aa)
片段:C-TERMINAL PROTEASE DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;294 K;0.1M MES pH6.5, 10% w/v polyethylene glycol 20000, 3% w/v 1,6-hexandiol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
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分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 2HKP SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfenic acid 提交 2006-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
403–621(219 aa)
片段:c-terminal catalytic domain
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;20% w/v PEG 3350, 0.2M NaCl and post-soaked in 50mM DTT for 48 hours, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 2HL8 SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfinic acid 提交 2006-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
403–621(219 aa)
片段:c-terminal catalytic domain
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;20%(w/v) PEG 3350, 0.2M NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 2HL9 SUMO protease Ulp1 with the catalytic cysteine oxidized to a sulfonic acid 提交 2006-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
403–621(219 aa)
片段:c-terminal catalytic domain
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289 K;30%(v/v) pentaerythritol ethoxylate(15/4 EO/OH), 0.05M ammonium sulfate, 100mM hydrogen peroxide , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 5H2V Crystal structure of the karyopherin Kap121p bound to the SUMO protease Ulp1p 提交 2016-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–150(150 aa)
片段:UNP residues 1-150
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.1M HEPES, 10% 2-propanol, 24% PEG20000
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分辨率 2.80 Å R-free 0.241 |
| 5H2W Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-340) 提交 2016-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
150–340(191 aa)
片段:UNP residues 150-340
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M MES, 0.1M calcium acetate, 12% PEG8000
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分辨率 2.50 Å R-free 0.247 |
| 5H2W Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-340) 提交 2016-10-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
150–340(191 aa)
片段:UNP residues 150-340
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1M MES, 0.1M calcium acetate, 12% PEG8000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.247 |
| 5H2X Crystal structure of the karyopherin Kap60p bound to the SUMO protease Ulp1p (150-172) 提交 2016-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
150–172(23 aa)
片段:UNP residues 150-172
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M sodium phosphate, 12% PEG8000
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分辨率 2.20 Å R-free 0.228 |