当前蛋白身份:Q02936
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AT0 17-kDA fragment of hedgehog C-terminal autoprocessing domain 提交 1997-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–402(145 aa)
片段:17-KDA FRAGMENT OF C-TERMINAL DOMAIN
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8;20% PEG 3350, 80 mM AMMONIUM SULFATE, 10 mM SODIUM CACODYLATE pH 5.8
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分辨率 1.90 Å R-free 0.275 |
| 2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 F
49–198(150 aa)
片段:protein hedgehog N-product
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
49–198(150 aa)
片段:protein hedgehog N-product
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
49–198(150 aa)
片段:protein hedgehog N-product
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
49–198(150 aa)
片段:protein hedgehog N-product
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 6TD6 Structure of Drosophila melanogaster Dispatched bound to a modified Hedgehog ligand, HhN-C85II 提交 2019-11-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–471(471 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.76 Å |
| 6TYY Hedgehog autoprocessing mutant D46H 提交 2019-08-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
258–403(146 aa)
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突变:D46H 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M Hepes, pH 7.5, 3.4 M sodium formate
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分辨率 1.36 Å R-free 0.195 |