当前蛋白身份:Q02936 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AT0 17-kDA fragment of hedgehog C-terminal autoprocessing domain 提交 1997-08-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–402(145 aa) 片段:17-KDA FRAGMENT OF C-TERMINAL DOMAIN
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8;20% PEG 3350, 80 mM AMMONIUM SULFATE, 10 mM SODIUM CACODYLATE pH 5.8
分辨率 1.90 Å R-free 0.275
2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 49–198(150 aa) 片段:protein hedgehog N-product
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 49–198(150 aa) 片段:protein hedgehog N-product
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 49–198(150 aa) 片段:protein hedgehog N-product
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2IBG Crystal Structure of Hedgehog Bound to the FNIII Domains of Ihog 提交 2006-09-11 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 49–198(150 aa) 片段:protein hedgehog N-product
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0M Na/K phosphate pH 6.4, 0.2M lithium sulfate, 0.05M CAPS pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
6TD6 Structure of Drosophila melanogaster Dispatched bound to a modified Hedgehog ligand, HhN-C85II 提交 2019-11-07 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–471(471 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.76 Å
6TYY Hedgehog autoprocessing mutant D46H 提交 2019-08-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 258–403(146 aa)
突变:D46H 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M Hepes, pH 7.5, 3.4 M sodium formate
分辨率 1.36 Å R-free 0.195