当前蛋白身份:Q03776 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5ZWN Cryo-EM structure of the yeast pre-B complex at an average resolution of 3.3 angstrom (Part II: U1 snRNP region) 提交 2018-05-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 T 1–544(544 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6G90 Prespliceosome structure provides insight into spliceosome assembly and regulation (map A2) 提交 2018-04-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:38-meric(38) 与全部聚合物一致
链 E 1–544(544 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Grids were blotted for 2-3.5 s and vitrified by plunging into liquid ethane with a FEI Vitrobot Mark III operated at 4 degree Celsius and 100% humidity.
分辨率 4.00 Å
6N7P S. cerevisiae spliceosomal E complex (UBC4) 提交 2018-11-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 D 1–544(544 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6N7R Saccharomyces cerevisiae spliceosomal E complex (ACT1) 提交 2018-11-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 D 1–544(544 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6N7X S. cerevisiae U1 snRNP 提交 2018-11-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 D 1–544(544 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7OQC The U1 part of Saccharomyces cerevisiae spliceosomal pre-A complex (delta BS-A ACT1) 提交 2021-06-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 E 1–544(544 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7OQE Saccharomyces cerevisiae spliceosomal pre-A complex (delta BS-A ACT1) 提交 2021-06-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:39-meric(39) 与全部聚合物一致
链 E 1–544(544 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
8W2O Yeast U1 snRNP with humanized U1C Zinc-Finger domain 提交 2024-02-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 D 1–544(544 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9;20 mM Hepes, pH7.9, 120 mM KCl, 2 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;The grids were obtained with the chamber at 100% humidity, 2.5 s blotting time, -6 blotting force and 15 s wait time and flash-frozen into liquid ethane with a Vitrobot Mark IV (Thermo Fisher Scientific)
分辨率 3.49 Å